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  • 2020-05-22[R]write.table時(shí)列名總是左移一位礼搁？補(bǔ)幾行小代碼完美解決

    問(wèn)題產(chǎn)生：有一天科室?guī)熋脝?wèn)：為什么我保存出來(lái)的數(shù)據(jù)喷舀，用excel打開(kāi)后列名總是被左移了一位盟庞？有沒(méi)有解決辦法惧财。答曰：直接在excel把他往右拖一位。師妹：可是我有二十多個(gè)這樣的...

  • 請(qǐng)問(wèn)一下为牍，大佬們已經(jīng)解決了嘛

    STEP6:WGCNA相關(guān)性分析

    因?yàn)闃颖緮?shù)量比較可觀馅精，所以可以進(jìn)行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來(lái)做WGCNA分析旁涤，挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合翔曲，或者顯著差異表達(dá)的基因集合等等。...

  • 老師你好執(zhí)行模塊與性狀相關(guān)性代碼時(shí)出現(xiàn)了下標(biāo)出界的報(bào)錯(cuò)劈愚，請(qǐng)問(wèn)老師這是哪里出錯(cuò)了??

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    STEP6:WGCNA相關(guān)性分析

    因?yàn)闃颖緮?shù)量比較可觀，所以可以進(jìn)行WGCNA分析算凿。這里是并不需要選取所有的基因來(lái)做WGCNA分析份蝴，挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合，或者顯著差異表達(dá)的基因集合等等氓轰。...

  • MEGA 構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)步驟

    【轉(zhuǎn)載】 分子進(jìn)化的研究對(duì)象是核酸和蛋白質(zhì)序列婚夫。研究某個(gè)基因的進(jìn)化，是用它的DNA序列署鸡，還是翻譯后的蛋白質(zhì)序列呢案糙？序列的選取要遵循以下原則：1）如果DNA序列的兩兩間的一致度...

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    跟著Nature Communications學(xué)畫(huà)圖：R語(yǔ)言ggplot2畫(huà)帶有底紋的柱形圖

    論文是 Bioactivity descriptors for uncharacterized chemical compounds 本地存儲(chǔ)文件名 s41467-021-2...

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    R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類熱圖 pheatmap

    前言 在前面的章節(jié)中时捌，我們介紹了如何使用 ggplot2 繪制熱圖 ggplot2 繪制熱圖的方式很多怒医，如 geom_raster、geom_tile 等 但通常僅僅繪制熱圖...

  • 用pheatmap畫(huà)熱圖

    假裝是前言 學(xué)了很久的R，一直也沒(méi)啥進(jìn)展拿诸，之前一直覺(jué)得R不是很容易的東西嗎扒袖，復(fù)制粘貼代碼就好了。亩码。emmm季率，太年輕太年輕。描沟。 我用R的日常就是畫(huà)熱圖飒泻，各種各樣的熱圖。所以網(wǎng)上...

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    R語(yǔ)言-第一次用RStudio 畫(huà)熱圖

    作業(yè) 1.read.table參數(shù)理解 file:文件名（包在“”內(nèi)，或者使用一個(gè)字符型變量）畦戒，可能需要全程路徑（注意即使是在windows下方库，符號(hào)\也不允許包含在內(nèi)，必須使...

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    轉(zhuǎn)錄組趨勢(shì)分析

    基本概念 表達(dá)趨勢(shì)分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類到一種變化趨勢(shì)中，從而找到實(shí)驗(yàn)變化過(guò)程中最具有代表性的基因集以及對(duì)應(yīng)的趨勢(shì)...

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    富集分析GO估蹄，KEGG塑煎，DO等

    市面上公司做RNA-Seq的一般流程是： tophat2 ---> Cufflinks ---> Cuffdiff ---> R tophat2是把reads回帖到基因組上；...

  • 請(qǐng)問(wèn)一下臭蚁，這里用的表達(dá)量是count值還是fpkm值

    轉(zhuǎn)錄組趨勢(shì)分析

    基本概念 表達(dá)趨勢(shì)分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類到一種變化趨勢(shì)中最铁，從而找到實(shí)驗(yàn)變化過(guò)程中最具有代表性的基因集以及對(duì)應(yīng)的趨勢(shì)...

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