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  • 2020-05-22[R]write.table時列名總是左移一位服傍？補幾行小代碼完美解決

    問題產(chǎn)生：有一天科室?guī)熋脝枺簽槭裁次冶４娉鰜淼臄?shù)據(jù)荚虚，用excel打開后列名總是被左移了一位？有沒有解決辦法。答曰：直接在excel把他往右拖一位盟庞。師妹：可是我有二十多個這樣的...

  • 請問一下，大佬們已經(jīng)解決了嘛

    STEP6:WGCNA相關(guān)性分析

    因為樣本數(shù)量比較可觀，所以可以進行WGCNA分析冒版。這里是并不需要選取所有的基因來做WGCNA分析，挑選的標準可以是top變異程度大的基因集合逞姿，或者顯著差異表達的基因集合等等辞嗡。...

  • 老師你好執(zhí)行模塊與性狀相關(guān)性代碼時出現(xiàn)了下標出界的報錯，請問老師這是哪里出錯了??

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    STEP6:WGCNA相關(guān)性分析

    因為樣本數(shù)量比較可觀挺狰，所以可以進行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來做WGCNA分析，挑選的標準可以是top變異程度大的基因集合丰泊，或者顯著差異表達的基因集合等等薯定。...

  • MEGA 構(gòu)建進化樹步驟

    【轉(zhuǎn)載】 分子進化的研究對象是核酸和蛋白質(zhì)序列。研究某個基因的進化瞳购，是用它的DNA序列话侄，還是翻譯后的蛋白質(zhì)序列呢？序列的選取要遵循以下原則：1）如果DNA序列的兩兩間的一致度...

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    跟著Nature Communications學畫圖：R語言ggplot2畫帶有底紋的柱形圖

    論文是 Bioactivity descriptors for uncharacterized chemical compounds 本地存儲文件名 s41467-021-2...

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    R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類熱圖 pheatmap

    前言 在前面的章節(jié)中，我們介紹了如何使用 ggplot2 繪制熱圖 ggplot2 繪制熱圖的方式很多罢屈，如 geom_raster嘀韧、geom_tile 等 但通常僅僅繪制熱圖...

  • 用pheatmap畫熱圖

    假裝是前言 學了很久的R锄贷，一直也沒啥進展，之前一直覺得R不是很容易的東西嗎曼月，復制粘貼代碼就好了谊却。。emmm哑芹，太年輕太年輕炎辨。。 我用R的日常就是畫熱圖聪姿，各種各樣的熱圖碴萧。所以網(wǎng)上...

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    R語言-第一次用RStudio 畫熱圖

    作業(yè) 1.read.table參數(shù)理解 file:文件名（包在“”內(nèi)羽德，或者使用一個字符型變量），可能需要全程路徑（注意即使是在windows下顶籽，符號\也不允許包含在內(nèi)玩般，必須使...

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    轉(zhuǎn)錄組趨勢分析

    基本概念 表達趨勢分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類到一種變化趨勢中匀伏，從而找到實驗變化過程中最具有代表性的基因集以及對應(yīng)的趨勢...

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    富集分析GO，KEGG剃诅，DO等

    市面上公司做RNA-Seq的一般流程是： tophat2 ---> Cufflinks ---> Cuffdiff ---> R tophat2是把reads回帖到基因組上巷送；...

  • 請問一下，這里用的表達量是count值還是fpkm值

    轉(zhuǎn)錄組趨勢分析

    基本概念 表達趨勢分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類到一種變化趨勢中矛辕，從而找到實驗變化過程中最具有代表性的基因集以及對應(yīng)的趨勢...

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