總目錄 分子對(duì)接1：PyMOL進(jìn)行可視化[http://www.reibang.com/p/18b4d56dc516]分子對(duì)接2：Autodock Vina進(jìn)行分子對(duì)接[h...
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分子對(duì)接2：Autodock Vina進(jìn)行分子對(duì)接 -
分子對(duì)接4：Autodock4進(jìn)行對(duì)接并PyMOL可視化總目錄 分子對(duì)接1：PyMOL進(jìn)行可視化[http://www.reibang.com/p/18b4d56dc516]分子對(duì)接2：Autodock Vina進(jìn)行分子對(duì)接[h...
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Bray-Curtis距離
Bray-Curtis距離是以該統(tǒng)計(jì)指標(biāo)的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的媒殉，主要基于OTUs的計(jì)數(shù)統(tǒng)計(jì)麻裁，比較兩個(gè)群落微生物的組成差異...
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擴(kuò)增子分析——usearch+vsearch+qiime1
參考文章：1.http://www.reibang.com/p/c72bb359f050[http://www.reibang.com/p/c72bb359f050]2....
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感謝作者寫得很詳細(xì)呵萨，請(qǐng)問有下游分析過程嗎??
擴(kuò)增子分析——usearch+vsearch+qiime1
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Qiime1-6.生成OTU表（基于RDP）本節(jié)介紹如何生成OTU铸磅。生成OTU的方法一共有三類：De novo,Closed-reference,Open-reference功炮。 在開始講解方法之前先簡(jiǎn)單說明一下什么是O...
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微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小結(jié)：從OTU table到marker物種筆記內(nèi)容：由二代測(cè)序產(chǎn)生的序列數(shù)據(jù)（.fastq）到OTU table筷弦， 距離矩陣肋演，物種多樣性指數(shù)，序列的進(jìn)化樹及物種注釋信息的可分析數(shù)據(jù)烂琴，為常規(guī)分析流程爹殊。可以使用usear...
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glmnetGlmnet主要用于擬合廣義線性模型奸绷。篩選可以使loss達(dá)到最小的正則化參數(shù)lambda梗夸。該算法非常快号醉，并且可以使用稀疏矩陣作為輸入反症。主要有線性模型用于回歸辛块，logistic...
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華農(nóng)研究生在讀润绵，生信在學(xué)，可接1對(duì)1保研輔導(dǎo)胞谈。
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使用Plink對(duì)CNV做GWAS分析（一）
Introduction 隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展呜魄，這些年關(guān)于CNV（拷貝數(shù)變異）的研究也逐漸多了起來悔叽。以往CNV主要通過PCR或者CGH芯片等技術(shù)進(jìn)行查找，現(xiàn)在由于二代測(cè)序...
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個(gè)性化生信分析
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機(jī)器學(xué)習(xí)之分類性能度量指標(biāo) : ROC曲線趟庄、AUC值、正確率伪很、召回率同見博客：http://zhwhong.cn/2017/04/14/ROC-AUC-Precision-Recall-analysis/(對(duì)Latex公式支持更好) 在分類任...
