這是ggplot2可視化專題的第二個實例操作 【ggplot2的基本思路見前文總論】:基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化:總述和分文目錄 【ggplot2繪圖具體...
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1灵汪、fastq文件 一般我們從公司里得到的原始測序數(shù)據(jù)都是屬于fastq.gz文件, .gz是一種壓縮格式的縮寫蔗候,于是首先第一步是對這些壓縮格式進行解壓操作 解壓好的文件即正...
GO和KEGG富集分析是生物信息分析中常用的一種分析怒允,針對不同的物種埂软,大概整理了一下锈遥,我將其分成四類纫事。 1. 人和小鼠等模式生物 最常用的就是clusterprofiler,...
RNAseq常規(guī)做法是先篩選出差異表達基因丽惶,然后針對篩選出來的差異基因做GO富集分析。 1.水稻爬立、小麥GO信息提取 在進行GO富集分析前首先要確定在你所使用的GO富集分析軟件...
前面給大家簡單介紹過?什么是Gene Ontology(GO)[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.co...
導讀 gggenes: Draw Gene Arrow Maps in 'ggplot2'。 Github:gggens[https://github.com/wilkox/...
這一次侠驯,我們來聊聊基因組注釋抡秆。首先問自己一個問題,為什么要進行基因注釋吟策。就我目前而言儒士,它用來解決如下問題: 在mapping-by-sequencing的時候,我找到了一些可...
本節(jié)我們繼續(xù)來進行基因家族數(shù)據(jù)可視化的第3節(jié)教程檩坚,通過ggplot2繪制一個富有美感的基因結(jié)構(gòu)圖&蛋白保守結(jié)構(gòu)域圖着撩,喜歡的小伙伴歡迎關(guān)注,多多支持匾委,原文鏈接:https://...
遇到了一個16S的課題赂乐,于是開始認真學習ASV和OTU的差別薯鳍,順手整理一下。 擴增子測序和鳥槍法測序已經(jīng)成為微生物組領(lǐng)域最常見的研究手段挨措。盡管鳥槍法測序可以為我們提供更高分辨...
寫在前面 常做分子實驗的小伙伴們,一定都離不開引物設(shè)計运嗜,其重要性我相信不用多說壶辜。而在我們設(shè)計引物的過程中,引物的特異性往往決定PCR的產(chǎn)物是否有雜帶担租,從而影響下游實驗砸民,直接影...
相信不少人看過下面這個類型的故事背亥,我把它稍作了個改編秒际。超逸和艾斯發(fā)現(xiàn)有兩個比自己來的晚的同事悬赏,山農(nóng)和辛普森,都已升職加薪娄徊,而自己卻一直原地不動闽颇。終于有一天,超逸忍不住了寄锐,冒著...
參考文章:1.http://www.reibang.com/p/c72bb359f050[http://www.reibang.com/p/c72bb359f050]2....
STAMP軟件安裝 軟件官網(wǎng)http://kiwi.cs.dal.ca/Software/STAMP 1. Microsoft Windows系統(tǒng)安裝比較簡單 2. ubun...
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)總覽 1)氨基酸序列2)周期性的結(jié)構(gòu)構(gòu)象3)整條多肽鏈的三維空間結(jié)構(gòu)4)多個亞基形成的復合體結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu) 二級結(jié)構(gòu)為蛋白質(zhì)經(jīng)過折疊盆顾,構(gòu)成的規(guī)則的片段援雇。 ...
來源https://www.sohu.com/a/164341318_732029 Top植物種的snoRNA基因數(shù)據(jù)庫蚕涤。 http://bioinf.scri.sari.a...