HISAT2是一個快速和敏感的比對軟件紊浩，用于將二代測序數(shù)據(jù)（DNA和RNA）比對到基因組數(shù)據(jù)。 官網(wǎng)：http://daehwankimlab.github.io/hisat...
IP屬地：海南
-
序列比對 —— Hisat2 -
RNA-seq分析（STAR-RSEM-DESeq2）
一费彼、準(zhǔn)備RNA-seq數(shù)據(jù) 需要參考基因組文件，注釋文件口芍，樣本的fastq.gz文件 檢查fastq.gz是否完整 二箍铲、fastqc生成質(zhì)量報告（multiqc 提高查看效率...
-
hisat2比對軟件將reads比對到參考基因組
轉(zhuǎn)載：https://biozx.top/hisat2.html[https://biozx.top/hisat2.html] HISAT2是TopHat2/Bowti2的繼...
-
RNA-seq用hisat2小染、stringtie翘瓮、DESeq2分析一、安裝軟件 1裤翩、HISAT2 將reads比對到基因組上 2资盅、StringTie 將比對好的reads進(jìn)行拼裝并預(yù)計表達(dá)水平 3、SAM tools 課上已經(jīng)用sudo a...
