什么是WGCNA 1 樣本聚類,查看是否有離群值 2. 找構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)合適的閾值 左圖縱軸:相關(guān)系數(shù)的平方堰氓,越高說明該網(wǎng)絡(luò)越逼近無網(wǎng)絡(luò)尺度的分布挤渐。右圖縱軸:Connectivit...
轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)分析通常包括以下幾個主要步驟: 質(zhì)量控制(Quality Control):對原始測序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量評估浴麻,檢查測序質(zhì)量指標(biāo)如序列長度分布、測序錯誤率等囤攀,確保...
WGCNA其譯為加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析。該分析方法旨在尋找協(xié)同表達(dá)的基因模塊(module)覆享,并探索基因網(wǎng)絡(luò)與關(guān)注的表型之間的關(guān)聯(lián)佳遂,以及網(wǎng)絡(luò)中的核心基因。適用于復(fù)雜的數(shù)據(jù)模式...