將reads比對到參考序列 http://www.biotrainee.com/thread-766-1-1.htmlhttps://bedto...

質(zhì)控 拼接 join_paired_ends.py -f 1_1.fq.gz -r 2_2.fq.gz -m fastq-join -o jo...

makeblastdb

安裝

Prodigal（基因預(yù)測） RNAmmer (rRNA預(yù)測) 先安裝hmmer-2.2g 下載http://www.cbs.dtu.dk/cg...

下載和安裝https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/files/GapCloser/ 使用 需要...

https://github.com/OpenGene/fastp安裝 使用 -i SS_G1.fastp.1.fq.tar.gz -I SS_...

手動安裝MetaWRAP 依賴軟件安裝--apt安裝 需要手動安裝的軟件 安裝完后雅宾，添加maxbin和quast軟件的路徑到path安裝Meta...