所用數(shù)據(jù)為一個(gè)屬內(nèi)不同種不同群體的葉綠體基因組序列待榔,數(shù)量為80條劲蜻。 發(fā)現(xiàn)用全長(zhǎng)序列建樹的時(shí)候毛俏,不適合選用太多外類群,否則ML法中會(huì)導(dǎo)致屬內(nèi)分枝的枝長(zhǎng)特別短杏死。原因應(yīng)該是基因間隔...
IP屬地:云南
所用數(shù)據(jù)為一個(gè)屬內(nèi)不同種不同群體的葉綠體基因組序列待榔,數(shù)量為80條劲蜻。 發(fā)現(xiàn)用全長(zhǎng)序列建樹的時(shí)候毛俏,不適合選用太多外類群,否則ML法中會(huì)導(dǎo)致屬內(nèi)分枝的枝長(zhǎng)特別短杏死。原因應(yīng)該是基因間隔...
關(guān)于為何要進(jìn)行SNP的過濾: 第一泵肄,低質(zhì)量和無(wú)信息的SNP會(huì)影響后續(xù)群體結(jié)構(gòu)或GWAS的分析結(jié)果,甚至影響后續(xù)對(duì)生物學(xué)問題的解釋淑翼;第二腐巢,群體研究時(shí),由于測(cè)序的個(gè)體較多檢測(cè)出來...
您好玄括,在過濾連鎖不平衡位點(diǎn)中冯丙,第二步,將map文件中的第二列改為每個(gè)snp位點(diǎn)特有的標(biāo)識(shí)符中遭京,提供的示例代碼可能出現(xiàn)了顯示錯(cuò)誤胃惜,您能不能在評(píng)論區(qū)把這段代碼分享一下,麻煩您了
2022-01-10###################################################################### ...