發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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開發(fā)一個(gè)Rshiny應(yīng)用（基礎(chǔ)）Introduction Shiny 是一個(gè) R 包，可輕松地直接從 R 構(gòu)建交互式 Web 應(yīng)用程序慷嗜。還可以在網(wǎng)頁上托管獨(dú)立應(yīng)用程序或?qū)⑺鼈兦度?R Markdown 文檔...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)---從原理到分析(Hisat2+Stringtie+Deseq2)一淀弹、 首先放一段illumina測序平臺的官方原理鏈接： https://www.bilibili.com/video/BV1Cx411p7dm[https://www.bi...
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我只是知識的搬運(yùn)工~
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不積跬步，無以至千里。
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寫了個(gè)小腳本autosnippy:自動(dòng)cgSNP分析
最近寫了一個(gè)snakemake流程策幼，方便自己跑SNP分析邑时。目前還是需要手動(dòng)編輯一個(gè)文件表，剩下就是直接等著收樹文件了垄惧。 安裝 首先克隆git clone https://gi...
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我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚類分析流程
個(gè)人進(jìn)行SNP分析用的軟件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]刁愿，主要是可以一次批量完成。準(zhǔn)備工作：1.待分析的序列文件（fa...
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比較與進(jìn)化基因組分析
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讓堅(jiān)持成為習(xí)慣
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八. SNP檢測和進(jìn)化分析（Snippy）
一. 簡介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP檢測的軟件脑题，可以通過分析得到核心SNP，進(jìn)行比對構(gòu)建進(jìn)化樹铜靶。 ...
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ReporterScore包(GRSA方法)正式發(fā)表于雜志Briefings in Bioinformatics最近叔遂，我開發(fā)的R包ReporterScore（GRSA方法）發(fā)表在Briefings in Bioinformatics上了，這是一種靈活的争剿，可用于復(fù)雜多組學(xué)數(shù)據(jù)的功能富集新...
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浙江大學(xué)蔣超課題組合作ES&T：開發(fā)使用可穿戴被動(dòng)采樣器對個(gè)體生物和化學(xué)暴露組與轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行縱向測繪我們實(shí)驗(yàn)室的子諾師姐開發(fā)了一種新型的用于個(gè)體生物和化學(xué)暴露組縱向測繪的可穿戴被動(dòng)采樣器：AirPie蚕苇。目前可以在一個(gè)驅(qū)蚊扣差不多大小的device上分析出數(shù)千種化合物和微生物...
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對群體遺傳學(xué)的基礎(chǔ)概念及相關(guān)分析，如系統(tǒng)發(fā)育研究蹬碧，PCA（主成分分析）舱禽、群體結(jié)構(gòu)分析、親緣關(guān)系恩沽、基因流等進(jìn)行介紹誊稚，旨在搭建一個(gè)群體遺傳學(xué)研究的學(xué)習(xí)平臺。
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KEGG 數(shù)據(jù)庫及API (2)Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）...
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KEGG 數(shù)據(jù)庫及API (1)Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）...
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如何獲取GO和KEGG注釋罗心、描述信息在非模式生物中片吊，我們想要獲取相應(yīng)物種的GO或KEGG注釋信息，或者描述信息的渠道很少协屡。數(shù)據(jù)分布不集中，需要我們花費(fèi)很長時(shí)間去收集全谤，整合肤晓，才能得到相應(yīng)的信息去做功能富集分析。下...
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遺傳學(xué) 博士研究生在讀
