發(fā)簡信
IP屬地：北京
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軟件17 —— DiffBind
一捕发、 基本介紹 DiffBind是鑒定兩個樣本間差異結(jié)合位點的一個R包指孤。主要用于peak數(shù)據(jù)集亲轨，包括對peaks的重疊和合并的處理字管，計算pea...
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軟件16 —— ChIPseeker
一、 基本介紹 ChIPseeker可以用來對ChIP-seq數(shù)據(jù)進行注釋與可視化。 二、 使用方法 (1) 安裝并載入R包 (2) bed...
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軟件15 —— exomePeak2
一、 基本介紹 exomePeak2使用bam文件進行peak calling以及peak統(tǒng)計挎袜，它整合了meRIP-seq數(shù)據(jù)分析的常規(guī)分析內(nèi)...
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軟件14 —— IGV一顽聂、 基本介紹 IGV（Integrative Genomics Viewer）是一款本地即可使用的基因組瀏覽器。支持BAM盯仪、SAM紊搪、GOBY...
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軟件13 —— rMATS一、 基本介紹 rMATS是一款對RNA-Seq數(shù)據(jù)進行差異可變剪切分析的軟件全景。其通過rMATS統(tǒng)計模型對不同樣本（有生物學(xué)重復(fù)的）進行可變剪...
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軟件12 —— bcftools一耀石、 基本介紹 VCF格式（Variant Call Format）是存儲變異位點的標(biāo)準(zhǔn)格式，用于記錄variants（SNP / InDel...
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軟件11 —— deeptools一爸黄、 基本介紹 deeptools是基于Python開發(fā)的一套工具滞伟，用于處理諸如RNA-seq、ChIP-seq炕贵、MNase-seq梆奈、ATAC...
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軟件10 —— HOMER和bedtools一、 基本介紹 HOMER（Hypergeometric Optimization of Motif EnRichment）称开，用于Motif的...
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軟件9 —— MACS2
一亩钟、 基本介紹 ※ 峰識別（peak calling）工具包括：MACS2和HOMER（適用于ChIP-seq和ATAC-seq）、HMMRA...