在本地使用Rstudio有很多的限制包吝，不能夠長時(shí)間跑程序，而服務(wù)器上能夠滿足R的很多條件张症，通過在服務(wù)器端安裝Rstudio能夠和本地一樣使用Rstudio检疫。服務(wù)器的Rstud...
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Rstudio Server的安裝和使用（附常見問題） -
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CentOS RStudio-server的安裝??安裝系統(tǒng)為CentOS屎媳，Rstudio-server的安裝需要管理員root權(quán)限夺溢。??親測此方法簡單有效～ 最后在瀏覽器中輸入IP:8787打開，然后輸入用戶名和密碼進(jìn)入...
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一個(gè)轉(zhuǎn)錄組上游分析流程 | Hisat2-Stringtie本期的教程代碼（部分） 以下為獲得.sort.bam文件后進(jìn)行運(yùn)行烛谊。 一风响、寫在前面 今天分享一個(gè)轉(zhuǎn)錄組上游分析的流程（Hisat2-Stringtie-Count），此流程的...
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越哥cuttag分析代碼留存
1持搜、trim_galore去接頭及低質(zhì)量reads 使用nohup掛后臺后可以用jobs -l查看 跑完以后在clean文件夾下，會有val_1和val_2生成焙矛，同時(shí)有一個(gè)r...
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RNA-seq 可變剪切可變剪切定義 有些基因的一個(gè)mRNA前體通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點(diǎn)）產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體葫盼，這一過程稱為可變剪接(或選擇性剪接， alternative s...
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2021-04-30 可變剪接與rMATS分析可變剪接(Alternative splicing)：一個(gè)基因的外顯子以不同的組合方式剪接形成不同的成熟RNA村斟，由此產(chǎn)生的不同的 mRNA 可能被翻譯成不同的蛋白質(zhì)構(gòu)體贫导，因此...
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詳細(xì)介紹最新版可變剪接軟件rMATS
作者：椰子糖審稿：童蒙編輯：amethyst 可變剪切能夠產(chǎn)生多種類型的mRNA，因此一個(gè)基因就可以產(chǎn)生多種不同的蛋白蟆盹。這個(gè)過程極大的增加了mRNA和蛋白質(zhì)的多樣性孩灯。可變剪切...
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Seurat4.0系列教程1：標(biāo)準(zhǔn)流程時(shí)代的洪流奔涌而至面哥，單細(xì)胞技術(shù)也從舊時(shí)王謝堂前燕，飛入尋常百姓家毅待。雪崩的時(shí)候尚卫，沒有一片雪花是無辜的，你我也從素不相識尸红，到被一起卷入單細(xì)胞天地吱涉。R語言和Seurat已以勢如破竹...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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ChIP-seq實(shí)踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關(guān)基因的GO分析)在實(shí)踐之前，我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識點(diǎn)：（參考文章：http://www.reibang.com/p/8aca72809c5c） 組蛋白修飾能預(yù)測染色質(zhì)的類型（異...
