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最近在進(jìn)行ATAC和RNA-Seq的聯(lián)合分析,由于處理的材料是時間相關(guān)的匙瘪,所以time-course也是一個可以分析的點(diǎn)醉顽。在一位劉潛老哥的幫助下羊赵,我找到了一篇靠譜熊 轉(zhuǎn)錄組時...
本內(nèi)容為【科研私家菜】R可視化之美之科研繪圖系列課程,快來收藏關(guān)注【科研私家菜】 實(shí)現(xiàn)R語言數(shù)據(jù)可視化ggplot繪制置信區(qū)間 01 單組置信區(qū)間繪制 添加置信區(qū)間的核心函數(shù)...
簡介 maSigPro栖榨,這是一款可以綜合分析時間序列RNA-seq的工具昆汹。這款工具最初由Conesa等人于2006年開發(fā),于2014年經(jīng)Nueda等人進(jìn)一步優(yōu)化而得到的 那么...
clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包澈驼,看過了它的繪圖就會使人沉迷于其顏值無法自拔艾杏。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔,加上了我的測試數(shù)據(jù)(還是以果蠅為例)盅藻。 一、...
需求是推動探索的重要動力!在學(xué)習(xí)的路上硕噩,很多東西都是從需求出發(fā)的假残!帶著目的去探索,能夠更快地找到與之對應(yīng)的解決方法炉擅。上個周辉懒,同學(xué)問我能不能畫這樣一個圖: 大概的意思就是先展示...
aplot Y叔開發(fā),拼圖解決坐標(biāo)對齊的問題 extrafont 解決ggplot2繪圖導(dǎo)出pdf文件中文字體亂碼的問題 對應(yīng)的B站介紹視頻https://www.bilib...
這個R tutorial描述如何使用ggplot2包修改x和y軸刻度颠印。同樣,該文包含如何執(zhí)行軸轉(zhuǎn)換(對數(shù)化抹竹,開方等)和日期轉(zhuǎn)換线罕。 準(zhǔn)備數(shù)據(jù) 使用ToothGrowth: 請確...
孟德爾隨機(jī)化(Mendelian Randomization, MR)是一種利用遺傳變異作為工具變量來探索潛在因果關(guān)系的統(tǒng)計(jì)方法。這種方法可以繞開傳統(tǒng)觀察性研究中的一些常見偏...
前面已經(jīng)簡單介紹過GWAS的概念雳殊,GWAS分析中所用到的文件以及分析流程橘沥,我們在GWAS分析結(jié)果文件中經(jīng)常會看到beta值和P值,他們分別代表什么意思夯秃?這兩個值又有什么關(guān)系呢...
Title: Association between Human Blood Metabolome and the Risk of Alzheimer's Disease L...