作者你好,那么接下來怎么做KEGG富集呢涯肩?用enrichKEGG的話轿钠,沒有organism
自己構(gòu)建物種包OrgDb,然后用clusterProfiler富集分析利用clusterProfiler進(jìn)行富集分析時(shí)病苗,發(fā)現(xiàn)網(wǎng)上沒有物種包OrgDb疗垛,利用網(wǎng)上教程構(gòu)建了一個(gè)。主要參考了劉小澤的簡(jiǎn)書硫朦,特別感謝一下4蟆!咬展! emapper首先得到注釋...
作者你好泽裳,請(qǐng)問”eggNOG annot“是sesame.emapper.annotations文件中的列名嗎?
構(gòu)建自己物種的orgDb1.首先安裝eggnog-mapper軟件 注釋所需要的物種數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址如下破婆,同時(shí)也可以用里面的腳本download_eggnog_data.py下載你所需要的數(shù)據(jù)庫: egg...
參考 BGI-online網(wǎng)站[https://www.bgionline.cn/docs.html#/handbook/introduction]使用BGI Online ...
中國茶樹原產(chǎn)地中心新論[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1MjcwMDE4NQ==&mid=2247486326&idx=1&sn=f...
HR全基因組關(guān)聯(lián)鑒定與茶葉滋味相關(guān)的分子標(biāo)記[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1MjcwMDE4NQ==&mid=2247485306...
代碼鏈接:Upset plot展示韋恩圖[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1MjcwMDE4NQ==&mid=2247485042&i...
茶樹PPI網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫[http://www.360doc.com/content/21/0127/22/71039787_959293228.shtml]