作者：麥茬道審稿：童蒙編輯：amethyst 隨著生物信息數(shù)據(jù)的爆發(fā)式增長荣暮，存儲生物信息的文件格式也多樣化起來庭惜，不同的文件格式往往有不同的目的：為了軟件之間的兼容性；人類可讀...
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Sam/Bam文件格式詳解
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全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析TWAS的原理與方法
作者：Resther審稿：童蒙編輯：angelica 什么是TWAS 對GWAS（genome-wide association study, 全基因組關(guān)聯(lián)分析）大家應(yīng)該比較...
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SMR 參考數(shù)據(jù)下載鏈接SMR 孟德爾隨機(jī)化分析參考數(shù)據(jù)下載鏈接： 鏈接：https://cncr.nl/research/magma/[https://cncr.nl/research/magma...
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一起來了解一下基因區(qū)間RangeData劉小澤寫于19.3.30我們肯定都遇到許多利用坐標(biāo)去處理范圍信息的需求穗酥，比如要定位基因組的某個(gè)位置护赊，這個(gè)位置可能代表了gene model 惠遏、genetic variants...
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TCGA 數(shù)據(jù)庫下載腫瘤樣本病理切片F(xiàn)FPE（福爾馬林固定石蠟包埋）2024年TCGA迎來改版，本文介紹的下載方式有一定變化骏啰。詳見：https://mp.weixin.qq.com/s/q6XFdEBWRHDfIHi09suIFQ[https...
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三元相圖怎么看怎么畫（附R代碼示例）什么是三元相圖 三元圖是重心圖的一種爽哎，它有三個(gè)變量，但需要三者總和為恒定值器一。在一個(gè)等邊三角形坐標(biāo)系中，圖中某一點(diǎn)的位置代表三個(gè)變量間的比例關(guān)系厨内。在群體遺傳學(xué)中祈秕，它被稱做Fin...
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深入解析Seurat整合單細(xì)胞數(shù)據(jù)函數(shù)FindIntegrationAnchors 2（CCA和L2正則化算法）hi 各位，今天我們來深入了解一下Seurat做多樣本整合的深入算法雏胃，CCA算法以及FindIntegrationAnchors函數(shù)中的的參數(shù)l2.norm 先來知道一下C...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析中的各種數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
單細(xì)胞分析世界里數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)多種多樣请毛，主流的四種數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)分別是Bioconductor主導(dǎo)的SingleCellExperiment，Seurat中的SeuratObject格式...
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nanoseq：用于納米孔三代測序分析的管道流程（三代測序全流程軟件）nanoseq簡介 nfcore/nanoseq 是用于Nanopore DNA/RNA測序數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析流程瞭亮，它能夠進(jìn)行基因識別方仿、解復(fù)合、質(zhì)量控制统翩、序列比對以及下游分...
