理解ChIP-Seq 到了目前這個(gè)水平俏让，我學(xué)習(xí)新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時(shí)已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫的問題了。我更多要去考慮一個(gè)技術(shù)的目的和意義竭望。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問題是基因在不...
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ChIP-seq基礎(chǔ)入門 -
bedtools不合格的使用介紹
如何使用bedtools處理Rang數(shù)據(jù) 什么是Range數(shù)據(jù) 參考基因組表示的是一種坐標(biāo)系統(tǒng)驳遵，比如說某一個(gè)物種基因組大小為100bp，那么他參考基因組就可以表示為[1,10...
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motifmatchr: 在R語言中分析peak中里是否有motif匹配
motifmatchr的作用就是分析眾多的序列和眾多的motifs, 從中找到哪個(gè)序列包含哪個(gè)motif. 它的核心函數(shù)就是matchMotifs，最大特點(diǎn)就是快羞福，因?yàn)樗玫?..
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機(jī)器學(xué)習(xí)面試題集 - 詳解四種交叉驗(yàn)證方法本文結(jié)構(gòu)： 什么是交叉驗(yàn)證法？ 為什么用交叉驗(yàn)證法哼御？ 主要有哪些方法坯临？優(yōu)缺點(diǎn)？ 各方法應(yīng)用舉例恋昼？ 什么是交叉驗(yàn)證法看靠？ 它的基本思想就是將原始數(shù)據(jù)（dataset）進(jìn)行分組，一...
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數(shù)據(jù)分析的一般流程（利用機(jī)器學(xué)習(xí)）
一液肌、EDA ------explore data analysis,顧名思義挟炬，數(shù)據(jù)探索性分析。主要目的是對(duì)數(shù)據(jù)有個(gè)大體的認(rèn)識(shí) 1嗦哆、看下整體數(shù)據(jù)信息谤祖，有多少行，多少特征老速，特征是...
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機(jī)器學(xué)習(xí)（5）——代價(jià)函數(shù)誤差分析代價(jià)函數(shù)簡介 ??代價(jià)函數(shù)(Cost Function),通常也被稱為損失函數(shù)(Loss Function)粥喜。這類函數(shù)是機(jī)器學(xué)習(xí)乃至整個(gè)數(shù)據(jù)科學(xué)學(xué)科中最為重要的一類函數(shù)模型，...
