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    ggplot2中theme函數(shù)調(diào)整

    整理一下ggplot2中theme函數(shù)的用法嘀粱,牽扯到很多參數(shù),怕自己下次忘了芝囤。 一次洼、自帶主題 ggplot2有內(nèi)置主題关贵,分別是:theme_gr...

  • UCSC ENSEMBL NCBI基因組各個(gè)版本對應(yīng)關(guān)系 下載地址

    一、對應(yīng)關(guān)系 NCBI的版本包括GRCh36,37,38卖毁,UCSC包括hg18,19,38, ENSEMBL有各種release揖曾,他們之間的對應(yīng)...

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    單細(xì)胞測序R包PAGODA使用

    pagoda是2016年在nature methods發(fā)表的一個(gè)分析單細(xì)胞測序的方法,這個(gè)包并不是很紅火亥啦,只是最近在學(xué)習(xí)另一個(gè)基于RNA速率推斷...

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  • R中連接

    在R語言中 paste 是一個(gè)很有用的字符串處理函數(shù)炭剪,可以連接不同類型的變量及常量。 函數(shù)paste的一般使用格式為: paste(..., s...

  • RNA-seq分析:從fastq到差異表達(dá)基因

    RNA-seq的數(shù)據(jù)分析是比較簡單基礎(chǔ)的分析翔脱,大概流程就是處理下機(jī)的fastq數(shù)據(jù)(trimmomatic)奴拦,比對到人類基因組(hisat2)然...

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    maftools使用

    maftools是對WGS和WES數(shù)據(jù)進(jìn)行上游分析之后,進(jìn)行somatic mutation分析的一個(gè)非常好用的包届吁,用非常簡短的幾行代碼即可出圖...

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