小弟讀過(guò)兩年書倦零，塵世中一個(gè)迷途小書僮<br><br>歡迎訪問(wèn): <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fthereallda.github.io%2F" target="_blank">https://thereallda.github.io/</a>
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ggplot2中theme函數(shù)調(diào)整整理一下ggplot2中theme函數(shù)的用法洽胶，牽扯到很多參數(shù)瓢阴，怕自己下次忘了络拌。 一鬼癣、自帶主題 ggplot2有內(nèi)置主題饵骨，分別是：theme_grey() 默認(rèn)背景翘悉，淺灰色背景...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
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NCBI教程（一）獲取基因（gene）或基因產(chǎn)物（gene product）的功能
原文地址：NCBI Find the function of a gene or gene product 下面開始哦妖混，我花了很長(zhǎng)時(shí)間想，到底應(yīng)該從哪個(gè)地方開始介紹NCBI資...
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UCSC ENSEMBL NCBI基因組各個(gè)版本對(duì)應(yīng)關(guān)系 下載地址
一轮洋、對(duì)應(yīng)關(guān)系 NCBI的版本包括GRCh36,37,38制市，UCSC包括hg18,19,38, ENSEMBL有各種release，他們之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系如下：GRCh36 (hg...
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R packages搜索神器pkgsearch使用
R學(xué)習(xí)使用中弊予，我們經(jīng)常需要使用各種分析神器——package包祥楣。各種包的使用，不僅加快了數(shù)據(jù)分析的速度汉柒，也將某些不可能變成可能误褪。那么，在海量第三方應(yīng)用中碾褂，如何找到我們最需要兽间、...
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機(jī)器學(xué)習(xí)入門知識(shí)整理
1. 機(jī)器學(xué)習(xí)基礎(chǔ)知識(shí)入門 入門知識(shí)我沒(méi)有太多可講的，詳細(xì)原理與基礎(chǔ)知識(shí)可參考https://www.cnblogs.com/subconscious/p/4107357.h...
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@Lynne_5ab4 FactoMineR包可以做主成分分析 R語(yǔ)言有自帶的函數(shù)kmeans()做聚類分析 如果你說(shuō)的是單細(xì)胞根據(jù)kmeans算法進(jìn)行聚類我知道cellrangerRkit可以??
單細(xì)胞測(cè)序R包PAGODA使用
pagoda是2016年在nature methods發(fā)表的一個(gè)分析單細(xì)胞測(cè)序的方法正塌，這個(gè)包并不是很紅火嘀略，只是最近在學(xué)習(xí)另一個(gè)基于RNA速率推斷細(xì)胞演化的R包velocyto...
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單細(xì)胞測(cè)序R包PAGODA使用pagoda是2016年在nature methods發(fā)表的一個(gè)分析單細(xì)胞測(cè)序的方法，這個(gè)包并不是很紅火问裕，只是最近在學(xué)習(xí)另一個(gè)基于RNA速率推斷細(xì)胞演化的R包velocyto...
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用anaconda安裝生信工具教程本貼出自徐州更老師的《生信必修課之軟件安裝》https://ke.qq.com/course/310838逮壁。僅做學(xué)習(xí)交流，不做商業(yè)用途粮宛，侵刪窥淆。 打開終端 轉(zhuǎn)到src文件夾下 ...
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生信技能樹忧饭，生信菜鳥團(tuán)，jimmy
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RNA-seq分析：從fastq到差異表達(dá)基因
RNA-seq的數(shù)據(jù)分析是比較簡(jiǎn)單基礎(chǔ)的分析刺洒，大概流程就是處理下機(jī)的fastq數(shù)據(jù)（trimmomatic），比對(duì)到人類基因組（hisat2）然后統(tǒng)計(jì)每個(gè)基因上出現(xiàn)的coun...
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【W(wǎng)ES文獻(xiàn)】新型復(fù)發(fā)突變基因和結(jié)直腸癌的預(yù)后突變特征
歡迎關(guān)注公眾號(hào)：oddxix Novel recurrently mutated genes and a prognostic mutation signature in c...
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R包——Mutational Pattern介紹 背景介紹 細(xì)胞的基因組不斷受到內(nèi)源性和環(huán)境性dna損傷的威脅吼砂，例如紫外線和自發(fā)反應(yīng)逆航。為了維護(hù)它們的基因組完整性，細(xì)胞利用各種機(jī)制修復(fù)受損的dna渔肩。無(wú)論是在復(fù)制之前不正確...
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你好因俐，請(qǐng)問(wèn)96個(gè)可能的三核苷酸變化是怎么計(jì)算出來(lái)的？為什么是96呢
R包——Mutational Pattern
介紹 背景介紹 細(xì)胞的基因組不斷受到內(nèi)源性和環(huán)境性dna損傷的威脅周偎，例如紫外線和自發(fā)反應(yīng)抹剩。為了維護(hù)它們的基因組完整性，細(xì)胞利用各種機(jī)制修復(fù)受損的dna蓉坎。無(wú)論是在復(fù)制之前不正確...
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maftools使用maftools是對(duì)WGS和WES數(shù)據(jù)進(jìn)行上游分析之后澳眷，進(jìn)行somatic mutation分析的一個(gè)非常好用的包，用非常簡(jiǎn)短的幾行代碼即可出圖蛉艾。 1.安裝 maftools...
