IP屬地：甘肅
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繪制染色體區(qū)塊圖目前繪制染色體的函數(shù)很少亦或者說(shuō)繪制得很難看，因此有必要自己設(shè)計(jì)一個(gè)繪圖腳本郭毕。繪圖函數(shù)設(shè)計(jì)可以從頭使用svg包來(lái)繪制朋魔，也可以使用一些現(xiàn)有包進(jìn)行繪...
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PS1 設(shè)置命題提示符
PS1 常用格式化符號(hào) \u: 當(dāng)前用戶名 \h: 主機(jī)名（短格式） \H: 主機(jī)名（完整格式） \w: 當(dāng)前工作目錄（相對(duì)路徑） \W: 當(dāng)前...
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vscode 中 python 沒(méi)有智能提示解決方案vscode 中提供智能提示的方法有很多，其一就是自己編輯用戶snippets唾戚，其二就是下載使用別人寫的snippets插件柳洋。而我們使用pyth...
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基因家族分析
CAFE4 1.生成cds文件以及pep文件 2.orthofinder 比對(duì)，建樹：orthofinder 比對(duì)的兩個(gè)文件用于后續(xù)分析：Spe...
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JCVI
共線性分析 輸入文件 序列文件和注釋文件：序列文件默認(rèn)只能輸入cds文件（尾綴cds）,注釋文件（尾綴bed）叹坦。--dbtype=DBTYPE ...
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MCScanX一.基本使用 輸入文件： 運(yùn)行命令： 這個(gè) gff 文件需要將兩個(gè)物種的GFF文件 cat 到一起 結(jié)果將會(huì)得到兩個(gè)文件：file.collin...
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DRIMM 鑒定多個(gè)物種共有區(qū)塊
挖掘多物種之間共有區(qū)塊 1.orthofinder 獲取 Orthogroups.tsv 文件 2.獲取物種之間的拷貝數(shù)(查文獻(xiàn)或ks分析) 3...
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重復(fù)基因鑒定原理
Gene duplication and evolution in recurring polyploidization–diploidizat...
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orthofiner
一. 使用 一般命令 這個(gè)命令會(huì)使用系統(tǒng)可以使用的全部線程進(jìn)行后續(xù)分析 一些參數(shù) 中途運(yùn)行的參數(shù) 使用 -b 參數(shù)時(shí)熊镣，在 OrthoFinder...