軌跡分析系列： 單細胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
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單細胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操 -
在Win10中安裝Ubuntu為什么要使用WSL 本地調試/測試服務器程序工作電腦是Win10系統(tǒng)，但目前大部分公司的服務器都是linux系統(tǒng)宜猜，某些要部署到服務器上的程序需要在本地進行測試時州泊，因啟動腳本都...
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ggplot2之文本換行在做基因富集時寸五，有些通路特別長衬衬，以至于使圖片的大小不好控制裤园，這種情況可以用stringr包的str_wrap來完成文本自動換行婆赠。如使用clusterProfiler的barp...
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KEGG pathway 注釋整理
KEGG pathway 注釋整理 獲得KEGG注釋 通過eggnog-mapper和interproscan兩個軟件(或數(shù)據(jù)庫)铐殃，可以獲得KEGG ORTHOLOGY(KO...
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差異表達基因分析：差異倍數(shù)(fold change), 差異的顯著性(P-value)Differential gene expression analysis：差異表達基因分析 Differentially expressed gene (DEG)：差異表達...
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eggNOG 對基因組進行GO注釋
簡要介紹利用eggNOG進行在線注釋GO 其原理將query序列與eggNOG編號的蛋白進行多序列比對海洼，確定保守位點，分析其進化關系富腊。 每個eggNOG編號的蛋白為一類蛋白坏逢。...
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diamond & blast：DNA蛋白序列比對
導讀 用query基因、DNA序列蟹肘、16S擴增子序列词疼、蛋白序列比對基因注釋、物種注釋 帘腹、基因功能注釋數(shù)據(jù)庫。Blast準確性高许饿，速度慢阳欲。Diamond速度更快，常用于二代測序...
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秘籍 | GitHub打不開陋率？一招搞定球化！正常網(wǎng)址打不開？太慢瓦糟？： https://github.com/PacificBiosciences/falcon/blob/HEAD/makefile[https://gi...
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