發(fā)簡信
IP屬地：江蘇
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生信 | iSeq超便捷呀邢！快速下載GSA/SRA/ENA的數(shù)據(jù)以及metadata信息一己肮、寫在前面 最近在下載GSA數(shù)據(jù)的時候發(fā)現(xiàn)一個小工具iSeq，簡直太好用了菌瘪，分享給大家须眷！iSeq的GitHub鏈接：https://githu...
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生信 | circos文件準(zhǔn)備大全（以擬南芥為例）一、寫在前面 扣扣群：559758504（目前無需驗證鸣剪，一鍵即可加入） 如果你不想學(xué)组底，老板又催著要丈积，你可以加群私聊我尋求幫助( $ _ $ )，...
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生信 | 生信人搭建數(shù)據(jù)庫的學(xué)習(xí)流程
寫在前面 目前各種組學(xué)培訓(xùn)開展的如火如荼债鸡，卻鮮有生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫搭建的相關(guān)教程和學(xué)習(xí)流程江滨。原因有以下幾個： 1.學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)庫的搭建付出多，回報少厌均。...
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生信 | IGV Web快速搭建（無需root唬滑，無需更改配置文件）最近需要將ATAC-Seq生成的bw導(dǎo)入IGV查看peak的分布情況，但是一個個的將bw文件從服務(wù)器上下載到本地再傳到IGV里面太麻煩了棺弊，偶然間...
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生信 | scATAC-Seq數(shù)據(jù)獲染堋（超快sra轉(zhuǎn)fq）部分代碼參考自10x genomics官網(wǎng)[what-is-cell-ranger-atac]，但絕大多數(shù)代碼融入了我自己的思考 1模她、上游分析（...
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生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級分析+多組學(xué)分析寫在前面 其實很多作者已經(jīng)探索的差不多了稻艰，相關(guān)腳本、教程也很多侈净，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧尊勿。有時候感覺是浪費時間，但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到...
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生信 | Circos實戰(zhàn)寫在前面 由于circos官網(wǎng)的教程太全面了畜侦，雖然好但反而感覺比較復(fù)雜元扔，難易上手，因此我將他們精簡了一下旋膳。由于官網(wǎng)的教程中包含的數(shù)據(jù)太雜了摇展，所以...
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生信 | Circos的安裝寫在前面的碎碎念 最近在嘗試Cricos這款優(yōu)秀的可視化軟件，但是在安裝的時候有一些問題溺忧，記錄一下咏连。首先我是conda的忠實用戶，因此下載軟件的...
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秘籍 | GitHub打不開鲁森？一招搞定祟滴！正常網(wǎng)址打不開？太慢歌溉？： https://github.com/PacificBiosciences/falcon/blob/HEAD/make...