galaxy 介紹 Galaxy 是由美國賓夕法尼亞州立大學(xué)（Penn State University）和約翰霍普金 斯大學(xué)（Jonns Hopkins Universit...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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galaxy 本地分析平臺建立
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conda踩坑記錄1.An unexpected error has occurred. Conda has prepared the above report.
想更新deeptools盖腕，但是發(fā)現(xiàn)無論如何都下載不了，并且有以下報錯 按照conda install安裝不了任何包浓镜，報一大段錯誤_E_vens怡寶-CSDN博客[https:...
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Cellrank：細(xì)胞分化軌跡的新秀說在前面 說到細(xì)胞分化軌跡的推斷溃列，想必很多小伙伴第一會想到的是monocle2這個軟件，但是它只能做到oneshot膛薛，不能捕捉到細(xì)胞分化的動態(tài)過程听隐。另一種高階的算法是RNA速...
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TCGAbiolinks全解析
部分一 第一步、數(shù)據(jù)下載階段 第二步：GDCdownload()下載GDCquery()得到的結(jié)果 第三步哄啄、數(shù)據(jù)處理 第四步：TCGAanalyze_Preprocessin...
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利用R包TCGAbiolinks進(jìn)行各種數(shù)據(jù)下載下載TCGA數(shù)據(jù)的方法有很多雅任，上一篇介紹了如何用gdc-client批量下載數(shù)據(jù)，基于網(wǎng)上有很多用TCGAbiolinks包下載數(shù)據(jù)的教程咨跌，所以也想學(xué)習(xí)一下這個方法沪么。TCGA...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘（一）：TCGAbiolinks包介紹
腫瘤基因組圖譜（TCGA）計劃是由美國National Cancer Institute（NCI）和National Human Genome Research Instit...
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單細(xì)胞分析之細(xì)胞交互-1：CellphoneDB常用的細(xì)胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.reibang.com/p/38a9376f5286]：是公開的人工校正的，儲存受體虑润、配體以及兩種相互作用...
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R escape包使用 2021-12-29安裝說明 escape是BiocManager中的一個庫包成玫，當(dāng)前版本 v1.4.0 (2021-12-29) 只有R 4.0能夠安裝， 由于平時使用的分析電腦沒有升級拳喻，還是R...
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Seurat對象中NicheNet分析以及circos可視化在這篇短文中，您可以學(xué)習(xí)如何在Seurat v3對象上執(zhí)行基本的NicheNet分析猪腕，以及如何在circos圖中可視化輸出冗澈。值得注意的是，我們作為NicheNet的開發(fā)者陋葡，通...
