head(fpkms[1:3,1:3]), ??我還楞了一下,這head似不似有點(diǎn)多余
count轉(zhuǎn)fpkm,tpm完整版參考資料:1.如何把從TCGA下載的HTseq count轉(zhuǎn)換成FPKM - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/4afbd...
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老師,您是咋確認(rèn)接頭序列是什么吸奴,我不知道 cutadapt --bwa -a 啥隐绵,網(wǎng)上找的17年的數(shù)據(jù),阿里卡多
遇到了一次colorspace的測(cè)序數(shù)據(jù)目前已經(jīng)是我接觸生物信息學(xué)的第四年了盲链,這里的內(nèi)容由于學(xué)業(yè)壓力也很久沒有更新蝇率,現(xiàn)在可以趁著寒假的空閑時(shí)間寫一寫最近遇到的東西。我通常處理的都是RNA-seq數(shù)據(jù)刽沾,也全是來自il...
我始終覺得侧漓,喜歡是需要表達(dá)出來的锅尘。第六感也很重要。如果第六感并沒有察覺到他對(duì)你的喜歡布蔗,那他可能是真的不喜歡你藤违。還有什么是愛?愛是隨時(shí)想到他就想聯(lián)系他纵揍,有什么事情都想要和他分享...
軌跡分析系列: 單細(xì)胞之軌跡分析-1:RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析(Pseudot...
學(xué)霸姐姐 yyds
單細(xì)胞之軌跡分析-2:monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列: 單細(xì)胞之軌跡分析-1:RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析(Pseudot...
常用的細(xì)胞通訊軟件:CellphoneDB[http://www.reibang.com/p/38a9376f5286]:是公開的人工校正的璧榄,儲(chǔ)存受體、配體以及兩種相互作用...
練習(xí)數(shù)據(jù)集的GEO編號(hào):GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
18年發(fā)的,文章比較早了雄卷,但是是第一篇小鼠心臟非心肌細(xì)胞圖譜搓蚪,很多綜述里都提到了這一篇,意義還是比較大的丁鹉。 HighlightsComprehensive transcrip...
18年發(fā)的妒潭,文章比較早了,但是是第一篇小鼠心臟非心肌細(xì)胞圖譜鳄炉,很多綜述里都提到了這一篇杜耙,意義還是比較大的。 HighlightsComprehensive transcrip...
編程對(duì)象簡(jiǎn)介 R雖然有S3、S4、(RC)Reference classes 三個(gè)面向?qū)ο蟮南到y(tǒng)和一個(gè)多由C語言構(gòu)建的基本類型(base types)团驱,但是一般S3就能夠滿足...
GSEA簡(jiǎn)介 基因集富集分析(GSEA)是一種計(jì)算方法摸吠,可確定先驗(yàn)定義的基因集是否在統(tǒng)計(jì)上顯示兩種生物學(xué)狀態(tài)之間存在顯著一致的差異。來自官網(wǎng):GSEA[https://www...
陳巍學(xué)基因:http://www.iqiyi.com/w_19rvim699t.html嚎花,這好像是QQ飛車的鏈接哈哈哈
走進(jìn)單細(xì)胞10X genomics了解什么是UMI寸痢,什么是barcode,再做分析之前紊选,知道他們是在測(cè)序中引入啼止,了解為什么引入即可。 看個(gè)簡(jiǎn)介的視頻吧 從了解10X genomics開始陳巍學(xué)基因:http:...
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向量空間 向量空間的概念 向量空間表示一整個(gè)空間的向量即横,然而,這并不意味著任意向量的集合就能被稱為向量空間裆赵。所謂向量空間东囚,必須滿足空間對(duì)線性運(yùn)算封閉(也即是相加和數(shù)乘)這一原...