head(fpkms[1:3,1:3]), ??我還楞了一下，這head似不似有點(diǎn)多余
count轉(zhuǎn)fpkm,tpm完整版參考資料:1.如何把從TCGA下載的HTseq count轉(zhuǎn)換成FPKM - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/4afbd...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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老師，您是咋確認(rèn)接頭序列是什么尔许，我不知道 cutadapt --bwa -a 啥巫俺，網(wǎng)上找的17年的數(shù)據(jù)偎谁，阿里卡多
遇到了一次colorspace的測序數(shù)據(jù)
目前已經(jīng)是我接觸生物信息學(xué)的第四年了筑辨，這里的內(nèi)容由于學(xué)業(yè)壓力也很久沒有更新俺驶，現(xiàn)在可以趁著寒假的空閑時間寫一寫最近遇到的東西。我通常處理的都是RNA-seq數(shù)據(jù)挖垛，也全是來自il...
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2022-12-05
我始終覺得痢毒，喜歡是需要表達(dá)出來的。第六感也很重要蚕甥。如果第六感并沒有察覺到他對你的喜歡哪替，那他可能是真的不喜歡你。還有什么是愛菇怀？愛是隨時想到他就想聯(lián)系他凭舶，有什么事情都想要和他分享...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
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學(xué)霸姐姐 yyds
單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操
軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
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單細(xì)胞分析之細(xì)胞交互-3：CellChat常用的細(xì)胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.reibang.com/p/38a9376f5286]：是公開的人工校正的，儲存受體呼伸、配體以及兩種相互作用...
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多個10x單細(xì)胞對象的合并和批次校正--seurat錨點(diǎn)整合+Harmony練習(xí)數(shù)據(jù)集的GEO編號：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)035--[sc]單細(xì)胞測序揭示小鼠心臟非心肌細(xì)胞之間的異質(zhì)性和互作18年發(fā)的括享，文章比較早了搂根，但是是第一篇小鼠心臟非心肌細(xì)胞圖譜，很多綜述里都提到了這一篇铃辖，意義還是比較大的剩愧。 HighlightsComprehensive transcrip...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)035--[sc]單細(xì)胞測序揭示小鼠心臟非心肌細(xì)胞之間的異質(zhì)性和互作
18年發(fā)的，文章比較早了娇斩，但是是第一篇小鼠心臟非心肌細(xì)胞圖譜仁卷，很多綜述里都提到了這一篇，意義還是比較大的犬第。 HighlightsComprehensive transcrip...
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GSEA背后的統(tǒng)計學(xué)原理GSEA簡介 基因集富集分析（GSEA）是一種計算方法，可確定先驗定義的基因集是否在統(tǒng)計上顯示兩種生物學(xué)狀態(tài)之間存在顯著一致的差異基矮。來自官網(wǎng)：GSEA[https://www...
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陳巍學(xué)基因：http://www.iqiyi.com/w_19rvim699t.html淆储，這好像是QQ飛車的鏈接哈哈哈
走進(jìn)單細(xì)胞10X genomics
了解什么是UMI，什么是barcode家浇，再做分析之前本砰，知道他們是在測序中引入，了解為什么引入即可钢悲。 看個簡介的視頻吧 從了解10X genomics開始陳巍學(xué)基因：http:...
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走進(jìn)單細(xì)胞10X genomics了解什么是UMI点额，什么是barcode，再做分析之前莺琳，知道他們是在測序中引入还棱，了解為什么引入即可。 看個簡介的視頻吧 從了解10X genomics開始陳巍學(xué)基因：http:...
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MIT線性代數(shù)總結(jié)筆記——列空間與零空間向量空間 向量空間的概念 向量空間表示一整個空間的向量，然而辞做，這并不意味著任意向量的集合就能被稱為向量空間琳要。所謂向量空間，必須滿足空間對線性運(yùn)算封閉（也即是相加和數(shù)乘）這一原...
