R/qtl是一個(gè)可擴(kuò)展的前鹅、交互的聘鳞、用于QTL定位的R包服协，集數(shù)據(jù)分析和繪圖于一體榜轿。特點(diǎn)是使復(fù)雜的QTL定位方法被廣泛使用汉规，使用戶專注于建模而不是計(jì)算包斑。 官網(wǎng)：https://r...
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1.QTL定位：Rqtl—— Single-QTL analysis -
9.5 GWAS顯著SNP篩選及曼哈頓圖繪制在R中進(jìn)行整理摘昌，pmap格式在下面帖子中有詳細(xì)介紹。第一列為SNP的ID虱颗，第二列為chr沥匈，第三列為SNP的位置，第四列開(kāi)始為每個(gè)性狀的SNP的P值忘渔。9.3 GWAS：關(guān)聯(lián)分析...
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CMplot報(bào)錯(cuò)missing value where TRUE/FALSE needed今天在使用CMplot畫(huà)曼哈頓圖時(shí)遇到一個(gè)bug：Error in if (sum(pvalueT <= 0) != 0 || sum(pvalueT > 1) != 0) ...
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作圖群體概念及分類介紹這是很多年前做的關(guān)于作圖群體的PPT高帖，懶得再排版了，直接截圖上傳了畦粮，需要PPT的可以私信小編散址。在介紹作圖群體前我們先看一下之類性狀和數(shù)量性狀的差別： 當(dāng)然還要知道幾個(gè)基本的概...
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種群動(dòng)態(tài)歷史評(píng)估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum）SFS的基本理解、介紹的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
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一文看懂三代組裝軟件——Flye
作者：童蒙編輯：angelica 一宣赔、介紹 Flye是用于單分子組裝數(shù)據(jù)的denovo基因組裝的軟件预麸。這個(gè)軟件可以用于各種數(shù)據(jù)集，從小的細(xì)菌到大的哺乳動(dòng)物儒将。 輸入是原始的Pa...
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