一條小咸魚
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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@liuDDDD 謝謝指出
WGCNA分析，簡(jiǎn)單全面的最新教程
本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程韧涨，參考了最新的文檔劲室。第一全的還在路上，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上娄蔼，歡迎點(diǎn)擊鏈接了解更多怖喻。 WGC...
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@fcdff9106d2c 個(gè)體信息作為批次對(duì)待
DESeq2差異基因分析和批次效應(yīng)移除
差異基因鑒定 基因表達(dá)標(biāo)準(zhǔn)化 不同樣品的測(cè)序量會(huì)有差異，最簡(jiǎn)單的標(biāo)準(zhǔn)化方式是計(jì)算counts per million (CPM)岁诉，即原始reads count除以總reads...
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哈佛大學(xué)單細(xì)胞課程|筆記匯總 （六）
生物信息學(xué)習(xí)的正確姿勢(shì) NGS系列文章包括 NGS基礎(chǔ) 涕癣、 在線繪圖 哗蜈、轉(zhuǎn)錄組分析（ Nature重磅綜述|關(guān)于RNA-seq你想知道的全在這 ）、ChIP-seq分析（ C...
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萬能轉(zhuǎn)換：R圖和統(tǒng)計(jì)表轉(zhuǎn)成發(fā)表級(jí)的Word坠韩、PPT距潘、Excel、HTML只搁、Latex音比、矢量圖等
R包export可以輕松的將R繪制的圖和統(tǒng)計(jì)表輸出到 Microsoft Office (Word、PowerPoint和Excel)氢惋、HTML和Latex中洞翩，其質(zhì)量可以直接...
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?esquisse: 快速可視化圖形的 Rstudio 插件
默認(rèn)識(shí)別當(dāng)前環(huán)境中所有的 DataFrame 做為可導(dǎo)入數(shù)據(jù)稽犁，自動(dòng)根據(jù)選擇的變量選擇合適的圖形類型并可手動(dòng)設(shè)置美學(xué)屬性，適合數(shù)據(jù)的快速簡(jiǎn)單探索菱农。 復(fù)雜一些的圖可以嘗試通過 I...
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哈佛大學(xué)單細(xì)胞課程：筆記匯總前篇
經(jīng)典賞析 NGS系列文章包括NGS基礎(chǔ)缭付、轉(zhuǎn)錄組分析（Nature重磅綜述|關(guān)于RNA-seq你想知道的全在這）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）循未、單細(xì)胞測(cè)...
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Seurat的單細(xì)胞免疫組庫分析來了陷猫！
使用Seurat進(jìn)行單細(xì)胞VDJ免疫分析 NGS系列文章包括NGS基礎(chǔ)、轉(zhuǎn)錄組分析（Nature重磅綜述|關(guān)于RNA-seq你想知道的全在這）的妖、ChIP-seq分析（ChIP...
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復(fù)現(xiàn)Cell附圖 |類器官的單細(xì)胞分析
大家好绣檬！我們又見面啦！今兒帶領(lǐng)大家復(fù)現(xiàn)一個(gè)小圖嫂粟。 這篇文章發(fā)表于2020年4月24日的Cell主刊娇未，題為Inhibition of SARS-CoV-2 Infections...
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圖形解讀系列 | 給你5個(gè)示例，你能看懂常用熱圖使用嗎星虹？
圖形解讀的一般原則：從圖的基本構(gòu)造入手零抬，拆解圖的橫軸代表什么、縱軸代表什么宽涌、幾何對(duì)象如點(diǎn)平夜、線、柱代表什么和對(duì)象的屬性如顏色大小代表什么卸亮，理解了各個(gè)部分忽妒，再整體解讀圖中的差異。...
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一個(gè)R包玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞免疫組庫分析兼贸，還能與Seurat無縫對(duì)接
在介紹clonotypr(https://github.com/mattfemia/clonotypr)包之前段直，我們需要先去解決幾個(gè)問題： （1）為什么要進(jìn)行單細(xì)胞免疫組庫的...
