IP屬地：四川
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EVM整合注釋及報錯
1 使用conda安裝EVM狸臣。conda源的evidencemodeler 不是作者編譯上傳的迷扇，所以pasa的依賴和庫都不在做瞪，如果是重新創(chuàng)建環(huán)境...
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PASA-alignAssembly PASA配置
安裝mysql之后忘記密碼了劲妙，查看用戶请敦，重置密碼贸营，加入pasa的用戶和密碼贾漏。 現(xiàn)在已經(jīng)配置好mysql的用戶和密碼惑申，可以進入下一步具伍，去除污染序列...
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提取染色體對應(yīng)三代hifi數(shù)據(jù)
近期做hic掛載發(fā)現(xiàn)一個物種的染色體有問題，需要把對應(yīng)兩條染色體的三代測序數(shù)據(jù)挑出圈驼，比對到兩條染色體上查看深度人芽，以及挑出這部分序列重新拼接，拿到...
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blastn報錯
近期在集群跑幾個污染分析的流程绩脆，從conda新裝了blast萤厅，之后報錯。 查詢可知靴迫，是因為blastn版本跟不上惕味，但事實上我安裝了最新的blas...
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braker3注釋基因組基因遇到的問題
1 安裝 參照“基因組結(jié)構(gòu)預(yù)測|Braker3流程”這篇知乎文章https://zhuanlan.zhihu.com/p/659050212[h...
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HiTE注釋重復(fù)序列
使用conda安裝HiTE 我本來打算安裝好之后使用conda-pack遷移到服務(wù)器使用，運行之后發(fā)現(xiàn)有部分依賴并不能被conda-pack遷移...
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個人塔式服務(wù)器搭建-生物信息分析本文從1 功能需求玉锌，2 硬件選擇名挥，3 搭建過程 三個方面來闡述。 1 功能需求 最近在進行植物基因組的組裝注釋和分析流程芬沉，需要一臺多線程的li...
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EDTA注釋重復(fù)序列報錯
使用conda安裝好EDTA環(huán)境 運行后發(fā)現(xiàn)LTR鑒定過程報錯 github搜索躺同，發(fā)現(xiàn)問題與LTR_retriever有關(guān)阁猜，遂指定LTR_ret...
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解決Repeatmodeler運行報錯
使用conda安裝了Repeatmodeler，版本為Version 2.0.5蹋艺。在基因組重復(fù)序列注釋過程中運行時間 過長剃袍，而且最終產(chǎn)生的文件中...