練習(xí)數(shù)據(jù)集的GEO編號：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
發(fā)簡信
IP屬地：湖北
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多個10x單細(xì)胞對象的合并和批次校正--seurat錨點整合+Harmony -
RNA-seq練習(xí) 第一部分（原始數(shù)據(jù)下載啄育，提取fastq文件罩润，fastqc質(zhì)控）原始數(shù)據(jù)來源于這篇文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE50177 1.下載原始數(shù)據(jù)https://...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心唐全，又辜負(fù)了努力
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RNA-seq入門實戰(zhàn)（零）：RNA-seq流程前的準(zhǔn)備——Linux與R的環(huán)境創(chuàng)建前言：進(jìn)行RNA-seq入門實戰(zhàn)首先需要有一定的linux與R基礎(chǔ)，推薦跟著B站生信技能樹-jimmy老師學(xué)習(xí)打牢基礎(chǔ)：【生信技能樹】生信人應(yīng)該這樣學(xué)linux(更新至第14...
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RNA-seq入門實戰(zhàn)（一）：上游數(shù)據(jù)下載垃帅、格式轉(zhuǎn)化和質(zhì)控清洗本節(jié)概覽：1.在文章中找到 GEO accession number, 從NCBI獲取數(shù)據(jù)SRR號2.在linux中使用prefetch命令根據(jù)SRR號下載SRA文件3.使用...
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TCGA 01 TCGAbiolinks下載轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)差異分析1. 準(zhǔn)備 安裝和導(dǎo)入TCGAbiolinks包 查看各個癌種的項目id延届，總共有65個ID值 查看project中有哪些數(shù)據(jù)類型，如查詢"TCGA-LUAD"贸诚，有7種數(shù)據(jù)類型...
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生信技能樹，生信菜鳥團(tuán)械念，jimmy
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免疫浸潤分析方法信息匯總整理這幾天看的文獻(xiàn)的重要信息头朱。 1. 去卷積方法 CIBERSORT CIBERSORT是2015年在Nature Methods發(fā)表的一個方法，現(xiàn)在被引量為84龄减，其方法摘要...
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凡是把孩子放到第一位的项钮，等待這個家庭的多半是悲劇
1/別把自己的夢想附加給孩子的未來 中國家長不同于外國家長的一點，不愿意接受自己的孩子是普通人希停。而目前中國寄纵，家長熱衷于搶跑。 2/請鼓勵你的孩子做一個幸福的普通人 對自己孩子...
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一個人也可以出發(fā)---昆大麗六日自由行（一）突如其來的假期 七月里水由，得知自己會有6天假期，不知道如何度過赛蔫。 想起自己很久沒有出去玩了砂客，于是計劃起一場一個人的旅行。世界那么大呵恢，去哪里好呢鞠值？六天的假期，國外就算了渗钉，除...
