零氏身、前言 （1）ONT：Oxford Nanopore Technologies（牛津納米孔測序） （2）初始組裝經(jīng)過基因組糾錯（polish）以及去冗余（purge）之后，...
發(fā)簡信
IP屬地：安徽
-
Nanopore-ONT：基因組組裝
-
genesorteR——比FindAllMarkers快一百倍！不知道大家有沒有在使用Seurat的FindAllMarkers時常常覺得計算時間過長，人生苦短，等待的時間真的很煎熬。genesorteR是一個用于單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的R軟件包...
-
富集的物種不是人咋整啊1.ID轉(zhuǎn)換 首先是要轉(zhuǎn)換ID,擬南芥是要TAIR id來做富集分析。怎么知道的呢制妄？ 如果拿ENTRIZID來做，會收到這樣式的報錯信息： 那我們就知道應(yīng)該用AT開頭的ID了...
-
跨越三十年的《Cell》與《Nature》, 終成諾獎一泵三、撒花~ 2024年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎被授予Victor Ambros與Gary Ruvkun耕捞，獲此殊榮主要是因為這兩位科學(xué)家在基因調(diào)控方面的研究貢獻(xiàn)[1]。人體內(nèi)的遺...
-
AutoHIC 自動糾正HiC掛載結(jié)果
相關(guān)成果發(fā)表在NAR烫幕，Zijie Jiang, Zhixiang Peng, Zhaoyuan Wei, Jiahe Sun, Yongjiang Luo, Lingzi B...
-
R-Seurat V5 to H5AD
最近想將單細(xì)胞數(shù)據(jù)從Seurat轉(zhuǎn)還到H5AD格式俺抽，但發(fā)現(xiàn)Seurat V5直接轉(zhuǎn)換會報錯。這里記錄一下解決的方案较曼。 直接轉(zhuǎn)換會報錯 Error in assay.group...
-
基因組結(jié)構(gòu)注釋1. 組裝基因組質(zhì)控 得到組裝好的基因組序列之后磷斧，首先要使用多種方法評估組裝質(zhì)量。這里用到2款可用于基因組組裝質(zhì)量評估的軟件——QUAST和BUSCO捷犹。 1.1 quast—...
-
Nat Med.作者提供全文的繪圖代碼弛饭，對于學(xué)習(xí)作圖很有幫助（一）本期教程 獲得本期教程全文代碼：在訂閱號后臺回復(fù)關(guān)鍵詞：20240923 2022年教程總匯 2023年教程總匯 引言 今天分享的文章是2024發(fā)表在Nat Med.期刊中，...
-
空間組學(xué)系列講座之—“繁花”技術(shù)萍歉，群雄逐鹿空間組學(xué)春秋戰(zhàn)國之際侣颂，群雄并起。近年來枪孩，生命科學(xué)領(lǐng)域的新起之秀--空間組學(xué)技術(shù)在各頂級研究所的不斷求索中日益精進(jìn)横蜒，各類新型方法不斷更新胳蛮、層出不窮，Visium丛晌、Xenium、...
