常用的細胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.reibang.com/p/38a9376f5286]：是公開的人工校正的坛芽，儲存受體淌铐、配體以及兩種相互作用...
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單細胞分析之細胞交互-1：CellphoneDB -
孟德爾隨機化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系1. 孟德爾隨機化方法 傳統(tǒng)觀察性流行病學研究在發(fā)現(xiàn)疾病病因以及因果推斷中存在諸多挑戰(zhàn)值朋，比如反向因果關(guān)聯(lián)澎羞、潛在混雜因素、微效暴露因素以及多重檢驗等，當研究者訴諸于隨機對照試驗...
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R語言批量去掉“雙引號”在GEO讀取矩陣文件，或者其他文件的時候常常會碰到下面這樣的情況 這樣對后面的ID轉(zhuǎn)化非常不方便雀久，所以我們要去掉雙引號代碼如下 但是要注意的是，我們是一整個矩陣趁舀，有幾千行赖捌，不...
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TwoSampleMR：兩樣本孟德爾隨機化孟德爾隨機化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系[http://www.reibang.com/p/8ac31267d3d8] 主要步驟：1. 讀取暴露因素GWAS數(shù)據(jù)選取合適...
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跟著Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2柱形圖和下三角熱圖完整示例論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specif...
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R數(shù)據(jù)分析：生存數(shù)據(jù)的預測模型建立方法與評價
之前寫了生存分析列線圖的做法，列線圖作為一個預測模型可視化工具矮烹，我們使用它的過程其實就是一個給新數(shù)據(jù)做預測的過程越庇，其內(nèi)在本身的模型就是我們基于現(xiàn)有數(shù)據(jù)訓練的一個預測模型，今天...
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Claudins家族1. 緊密連接和Claudins家族 相鄰上皮細胞之間的細胞旁空間被幾種類型的細胞-細胞連接所密封擂送，其中一種是緊密連接（Tight Junction， TJs）唯欣。TJs是正常...
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最新9.6分1區(qū)文章嘹吨，基因家族單腫瘤生信+實驗
**影響因子9.685 關(guān)于單基因生信+實驗驗證發(fā)高分雜志，我們也解讀過類似的文章境氢。** 我們可以綜合各個文章中的內(nèi)容蟀拷，篩選新的基因集/復合物/通路/基因家族等進行分析。如果...
