1. 在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列。 2. 在創(chuàng)建好的文件夾下面欧漱，比如我的是 /Users/jimmy/tmp/1/2/3/...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
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生信入門(mén)之初級(jí)作業(yè)及答案
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三代測(cè)序技術(shù)簡(jiǎn)介現(xiàn)在的第三代測(cè)序技術(shù)中，主要以PacBio公司的SMRT和Oxford的Nanopore技術(shù)為主。與前面的兩代技術(shù)比較需纳，第三代最主要的特點(diǎn)在于單分子測(cè)序宋欺，就是測(cè)序的過(guò)程無(wú)需進(jìn)...
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全基因組組裝，注釋與評(píng)估軟件集錦（更新于2020.03.20）
1.Assembly 1.1質(zhì)體基因組 1.1.1NOVOPlasty program language：Perl Reference： 10.1093/nar/gkw95...
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基因家族分析八(計(jì)算串聯(lián)重復(fù)基因KAKS值)1.準(zhǔn)備文件 即要是1雪营，2是一對(duì)串聯(lián)重復(fù)弓千，就將其放在一個(gè)文件內(nèi)。在上一步獲得的文件献起，一對(duì)重復(fù)基因是一行洋访，所以我們就將兩列一行轉(zhuǎn)為一列兩行，并以?xún)尚袨闇?zhǔn)分割文件谴餐，最后利用生成的...
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48個(gè)實(shí)用的生信在線工具在線工具一般具有“功能強(qiáng)大姻政、操作簡(jiǎn)單、無(wú)需安裝岂嗓、用完就走”的特點(diǎn)汁展，輕松實(shí)現(xiàn)“用別人的服務(wù)器分析自己的數(shù)據(jù)”。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
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使用MAKER進(jìn)行基因注釋(基礎(chǔ)入門(mén)）
在基因組注釋上，MAKER算是一個(gè)很強(qiáng)大的分析流程食绿。能夠識(shí)別重復(fù)序列侈咕，將EST和蛋白序列比對(duì)到基因組，進(jìn)行從頭預(yù)測(cè)器紧，并在最后整合這三個(gè)結(jié)果保證結(jié)果的可靠性耀销。此外，MAKER還...
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基因家族分析1 || 基本概念及數(shù)據(jù)下載基本分析內(nèi)容 ? 基因家族概念? 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索與成員鑒定? 蛋白成員基本特性和基因結(jié)構(gòu)分析? 多序列比對(duì)和進(jìn)化樹(shù)分析? 保守結(jié)構(gòu)域和模體分析（motif注釋...
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常用生物信息學(xué)分析在線網(wǎng)址生物信息學(xué)分析和作圖是科研狗們的必備技能品洛。近幾年树姨，隨著數(shù)據(jù)類(lèi)型的增多，excel桥状、SPSS等常用軟件已經(jīng)不能滿(mǎn)足科研需求了帽揪。R語(yǔ)言以其方便、快捷的優(yōu)勢(shì)辅斟，迅速獲得許多編程技術(shù)不...
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Phylogeny系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的一鍵化構(gòu)建——Perl_pipeline背景 一行命令構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)转晰。其實(shí)這個(gè)想法去年的時(shí)就開(kāi)始構(gòu)思了。當(dāng)時(shí)在給師兄師姐幫忙構(gòu)建幾個(gè)基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)士飒，還是用著以前本科時(shí)候就學(xué)會(huì)的幾個(gè)Windows下的建樹(shù)軟件M...
