多組學分析之間一定要保證不同組學，以及上下游都使用相同的參考基因組悴品，這次筆記每個物種數(shù)據(jù)涉及兩個組學維度的數(shù)據(jù)怔匣，所有一定要保證這兩組學數(shù)據(jù)用的同一個參考基因組，也就是使用的....
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Cellranger 多組學構(gòu)建自己的參考基因組 -
16sRNA 微生物組學分析（一）：從fastq到菌屬豐度表16s RNA ：16s rDNA 基因存在于所有細菌的基因組中亏狰，具有高度的保守性役纹。 該序列包含9個高變區(qū)和10個保守區(qū)，通過對某一段高變區(qū)序列進行PCR擴增后進行測序暇唾，得到...
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@小橘子_5e3b 可以改的哦促脉，在軟件的Style 里
Cytoscape + STRING + cytoHubba 聯(lián)合使用尋找hub基因
今天是不用學代碼利用生信軟件聯(lián)合“點點點”就可以取得hub基因的“白癡”實操，趕快點起來～ Hub基因（關(guān)鍵基因）是在生物學過程中發(fā)揮重要作用的基因策州，它往往在通路中為主導地位...
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@e73236e5d7ff 用cytoHubba 篩選一些關(guān)鍵點
Cytoscape + STRING + cytoHubba 聯(lián)合使用尋找hub基因
今天是不用學代碼利用生信軟件聯(lián)合“點點點”就可以取得hub基因的“白癡”實操瘸味，趕快點起來～ Hub基因（關(guān)鍵基因）是在生物學過程中發(fā)揮重要作用的基因，它往往在通路中為主導地位...
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下載TCGA 表達數(shù)據(jù)并對照表型數(shù)據(jù)拿到表達矩陣下載TCGA 表達數(shù)據(jù)并對照表型數(shù)據(jù)拿到表達矩陣 文章看得多的小伙伴都知道TCGA數(shù)據(jù)庫够挂，大多研究者在文章里都利用過TCGA的數(shù)據(jù)來驗證他們的數(shù)據(jù)分析結(jié)果旁仿，所以TCGA數(shù)據(jù)的...
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試試把上下調(diào)基因分開導入找hub
Cytoscape + STRING + cytoHubba 聯(lián)合使用尋找hub基因
今天是不用學代碼利用生信軟件聯(lián)合“點點點”就可以取得hub基因的“白癡”實操，趕快點起來～ Hub基因（關(guān)鍵基因）是在生物學過程中發(fā)揮重要作用的基因孽糖，它往往在通路中為主導地位...
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Cytoscape + STRING + cytoHubba 聯(lián)合使用尋找hub基因今天是不用學代碼利用生信軟件聯(lián)合“點點點”就可以取得hub基因的“白癡”實操枯冈，趕快點起來～ Hub基因（關(guān)鍵基因）是在生物學過程中發(fā)揮重要作用的基因毅贮，它往往在通路中為主導地位...
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單細胞層面剖析癌癥靶向治療中的持久耐藥性細胞過去的幾十年里，我們見證了治療癌癥——分子靶向治療的飛速發(fā)展和演變尘奏，但在靶向癌癥治療中會出現(xiàn)‘持久耐藥性’細胞滩褥，它一直是影響癌癥患者預后的最大挑戰(zhàn)。如何消除這些“持久性耐藥細...
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使用R web框架Shiny輕松構(gòu)建生信交互式網(wǎng)站做生信需要懂 R web框架 Shiny嗎罪既？答案：不懂R Shiny的生信科研工作者不是好生信科研者 說說這幾年我用web框架參與構(gòu)建生信網(wǎng)站的項目（就是我搬的磚）钠右，1.某病...
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pbmc_10k_v3.rds 這個rds 的數(shù)據(jù)來源和數(shù)據(jù)處理流程在哪里看呢？
使用Signac包進行單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)分析（一）：Analyzing PBMC scATAC-seq
Signac是Seurat的一個擴展功能R包兼贸，可以用來分析、解釋和探索單細胞染色質(zhì)數(shù)據(jù)集饥脑。目前阿蝶，Signac包主要專注于分析單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)，之后還會添加其他基于染...
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和樓上同問，你解決了嗎苛蒲？??
Seurat對象卤橄、SingleCellExperiment對象和scanpy對象的轉(zhuǎn)化
Seurat官網(wǎng)：https://satijalab.org/seurat/articles/conversion_vignette.html[https://satijal...
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10× Genomics單細胞免疫組庫VDJ分析必知必會我們生活著的世界并非只有我們自己，而是有很多小于或大于我們的生物不斷與我們交互著扮念，有的讓我們開心损搬，有的使我們傷心。這就關(guān)系到一個本質(zhì)的問題： 我是誰？ 我是一個腦袋巧勤，一個軀體...
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為什么我現(xiàn)在訪問在頁面上沒看到“read files”這個功能項
下載ENA數(shù)據(jù)庫文件
ENA數(shù)據(jù)庫：European Nucleotide Archive：隸屬EBI (European Bioinformatics Institute)沽瞭，由 EBI 負責維護...
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R畫圖帶中文不顯示的解決方法畫出的圖導出pdf 后圖的中文標題和圖例不顯示，需要加入如圖所示的代碼剩瓶，指定標題字體和整個圖的字體 中文寫出的文件亂碼用fileEncoding='uft-8'
