生信編程日常

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FASTQC-遇到的java.lang.NullPointerException: Cannot load from short array because "sun.awt.FontConfi...
問題最初產(chǎn)生于conda安裝了java-jdk和fastqc后谅河，fastqc仍然無法使用，用java --version確認(rèn)之后發(fā)現(xiàn)java的V...

3028 0 0
GEO數(shù)據(jù)上傳
1确丢、創(chuàng)建賬號將數(shù)據(jù)上傳到GEO[https://www.plob.org/tag/geo]數(shù)據(jù)庫绷耍，首先要創(chuàng)建并登陸NCBI帳號，然后進入提交的...

3.8 953 1 2

awk比較兩文件（-）
發(fā)現(xiàn)awk比較的時候可以用-代替某一個文件鲜侥，這樣讓整個代碼更靈活：取代第一個文件的位置：這樣在提取bam文件的信息的時候比較方面褂始，比如：

4.7 334 0 3
解決python中導(dǎo)出的pdf不能編輯問題
python默認(rèn)輸出的pdf格式是type3，這種不能在 Adobe Illustrator中編輯文字等信息描函，需要改成type42. 或者直接更...

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R語言z-score轉(zhuǎn)p.value
z-score計算方法為：Z =（x-μ）/ σμ為均值崎苗，σ為標(biāo)準(zhǔn)差。以下是R中將z-score轉(zhuǎn)為p.value的方法： pnorm(q, ...

5.1 4826 0 3
ggplot2 annotate文本設(shè)置意大利斜體
有時ggplot作圖時希望某些字變成斜體舀寓，可以導(dǎo)入Unicode包實現(xiàn)：可以實現(xiàn)p為斜體：注意保存的時候胆数，要使用cairo_pdf()而不是...

5.2 3061 0 2
解決devtools.install中的/bin/gtar:not found問題
來自https://github.com/r-dbi/RPostgres/issues/110[https://github.com/r-dbi...

5.2 692 0 1

解決matplotlib中的Invalid DISPLAY variable錯誤
在本地pyplot畫圖可以運行，但是在服務(wù)器顯示以下錯誤：其實這是因為matplotlib是默認(rèn)畫圖backend是TkAgg互墓，這個需要有GU...

5.2 756 0 3
bigwig轉(zhuǎn)bed文件
bigwig轉(zhuǎn)bed文件首先需要將bigwig轉(zhuǎn)為wig文件利用BEDOPS的 wig2bed]將wig文件轉(zhuǎn) bed文件參考：https:...

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