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ggplot2: geom_smooth() & stat_smooth() -
DoHeatmap的優(yōu)化+ComplexHeatmap繪制帶特定基因的單細(xì)胞熱圖單細(xì)胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.reibang.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
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cellranger multi使用（單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組+VDJ）單細(xì)胞大多數(shù)東西我都不是那么想寫逻族，因?yàn)榫褪钦罩鞒坛慕觥６覍懙娜送Χ嗟牧巳鹦牛徊钗乙粋€(gè)。但是最近谷歌了一下cellranger multi的中文教程惹谐，都沒有讓我滿意的，就寫一個(gè)...
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Docker部署Rstudio Server【二】：docker多參數(shù)設(shè)置
上一節(jié)內(nèi)容我們成功將Rstudio Server鏡像運(yùn)行起來，這一節(jié)讓我們把docker鏡像打造成可實(shí)際使用的工具墅垮。 docker鏡像運(yùn)行中的關(guān)鍵參數(shù) 目錄映射-v dock...
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文獻(xiàn)速遞||R包DropletUtils-基于droplet的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)cell calling方法歡迎關(guān)注同名公主號：BBio 10X也是基于此文獻(xiàn)的，考古一下耕漱，學(xué)習(xí)區(qū)分空載和真實(shí)細(xì)胞大體思路算色。 當(dāng)時(shí)已經(jīng)存在的一些方法會假設(shè)含有細(xì)胞的GEMs會有更高的UMI總數(shù)，并以UM...
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scCustomize：自定義可視化你的單細(xì)胞數(shù)據(jù)（一）簡介 scCustomize是一個(gè)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可視化的R包螟够，里面集合了一些常用的數(shù)據(jù)可視化方法灾梦，可以與Seurat包進(jìn)行很好的聯(lián)用，支持Seurat妓笙，LIGER和SCE等...
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Scissor：聯(lián)合表型數(shù)據(jù),Bulk-seq和scRNA(1)在上篇棉花相關(guān)的單細(xì)胞帖子我提到過： 文中是這樣說的：Guided by the bulk samples of cotyledons (0, 12, 24, 36 and ...
