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單細胞繪圖系列: Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.reibang.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
單細胞大多數(shù)東西我都不是那么想寫,因為就是照著流程抄。而且寫的人挺多的了虑稼,不差我一個把将。但是最近谷歌了一下cellranger multi的中文教程检眯,都沒有讓我滿意的瓶颠,就寫一個...
上一節(jié)內(nèi)容我們成功將Rstudio Server鏡像運行起來围来,這一節(jié)讓我們把docker鏡像打造成可實際使用的工具匾浪。 docker鏡像運行中的關(guān)鍵參數(shù) 目錄映射-v dock...
歡迎關(guān)注同名公主號:BBio 10X也是基于此文獻的皇帮,考古一下,學(xué)習(xí)區(qū)分空載和真實細胞大體思路户矢。 當(dāng)時已經(jīng)存在的一些方法會假設(shè)含有細胞的GEMs會有更高的UMI總數(shù)玲献,并以UM...
簡介 scCustomize是一個單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可視化的R包,里面集合了一些常用的數(shù)據(jù)可視化方法虏劲,可以與Seurat包進行很好的聯(lián)用托酸,支持Seurat,LIGER和SCE等...
在上篇棉花相關(guān)的單細胞帖子我提到過: 文中是這樣說的:Guided by the bulk samples of cotyledons (0, 12, 24, 36 and ...
上周微信小伙伴問了一個圖溶耘,想要用ggplot做擬時熱圖二拐,其實我在看文獻的時候,已經(jīng)想要復(fù)現(xiàn)了凳兵,所以這里寫一篇帖子百新,將一眾問題一網(wǎng)打盡。**這是一篇超長貼庐扫,我們的內(nèi)容還是一如既...