BAM文件flag記錄 1：該read是成對(duì)的paired reads中的一個(gè)2：paired reads中每個(gè)都正確比對(duì)到參考序列上4：該read沒(méi)比對(duì)到參考序列上8：與該...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：吉林
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samtools Bam文件常用操作
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什么是K線跳空
跳空缺口與回補(bǔ) 是指相鄰的兩根 K線間沒(méi)有發(fā)生任何交易,由于突發(fā)消息的影響,或者投資者比較看好或看空時(shí),股價(jià)在走勢(shì)圖上出現(xiàn)空白區(qū)域,這就是跳空缺口蟋恬；在股價(jià)之后的走勢(shì)中哟忍，將跳空...
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單細(xì)胞測(cè)序GSVA基因集變異分析GSVA基因集變異分析結(jié)合limma包分析差異基因集 基因集變異分析即GSVA（Gene set variation analysis）,是一種非參數(shù)的無(wú)監(jiān)督分析方法尚骄，主要用...
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單細(xì)胞測(cè)序細(xì)胞類(lèi)型鑒定——肥大細(xì)胞肥大細(xì)胞特性 肥大細(xì)胞（mast cell）姜骡，發(fā)育源于骨髓CD34+前體細(xì)胞贡茅，廣泛分布于皮膚及內(nèi)臟粘膜下的微血管周?chē)钍M織中肥大細(xì)胞不多咪奖，是連接神經(jīng)系統(tǒng)和免疫系統(tǒng)的橋梁。 形...
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ComplexHeatmap相關(guān)性分析繪制熱圖加載包治筒、數(shù)據(jù) 使用Hmisc包rcorr()函數(shù)計(jì)算一個(gè)矩陣的所有可能的列的皮爾遜或斯皮爾曼相關(guān)系數(shù)屉栓，對(duì)于大量的基因數(shù)據(jù)，該方法非呈噶叮快系瓢。ComplexHeatmap制作熱圖。...
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GEO RNAseq與chip seq數(shù)據(jù)整合
GEO數(shù)據(jù)有芯片數(shù)據(jù)句灌，也有RNAseq數(shù)據(jù)夷陋，芯片數(shù)據(jù)一般是經(jīng)過(guò)背景校正、標(biāo)準(zhǔn)化過(guò)的胰锌。如果表達(dá)量較小骗绕，說(shuō)明是經(jīng)過(guò)log2轉(zhuǎn)化。 RNAseq數(shù)據(jù)有counts矩陣资昧，也有FPKM...
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STAR序列比對(duì)（測(cè)試支原體污染序列）轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)唯一比對(duì)率特別低酬土，進(jìn)一步將未比對(duì)到參考基因組的序列提出來(lái)比對(duì)到NCBI NT庫(kù)。發(fā)現(xiàn)多數(shù)序列比對(duì)到了Mycoplasma hyorhinis格带，懷疑是支原體污染撤缴，...
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Seurat 報(bào)錯(cuò)-namespace:spatstat
加載Seurat包報(bào)錯(cuò)刹枉，莫名其妙，之前用的好好的屈呕。不知道什么時(shí)候安裝包存在兼容性問(wèn)題微宝，只能先刪除掉。
