發(fā)簡信
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單細胞測序細胞類型鑒定——肥大細胞肥大細胞特性 肥大細胞（mast cell）溯壶，發(fā)育源于骨髓CD34+前體細胞镣屹，廣泛分布于皮膚及內(nèi)臟粘膜下的微血管周圍圃郊，組織中肥大細胞不多，是連接...
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samtools Bam文件常用操作
BAM文件flag記錄 1：該read是成對的paired reads中的一個2：paired reads中每個都正確比對到參考序列上4：該re...
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linux下R 語言安裝
Linux環(huán)境下安裝R 報錯:configure: error: libcurl >= 7.28.0 library and headers a...
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mask RCNN實現(xiàn)實例分割2017年Google公司開放了TensorFlow Object Detection API野瘦，該項目實現(xiàn)了多種深度學(xué)習(xí)框架描沟，包括mask RC...
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單細胞測序GSVA基因集變異分析GSVA基因集變異分析結(jié)合limma包分析差異基因集 基因集變異分析即GSVA（Gene set variation analysis）,是一種...
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ComplexHeatmap相關(guān)性分析繪制熱圖加載包、數(shù)據(jù) 使用Hmisc包rcorr()函數(shù)計算一個矩陣的所有可能的列的皮爾遜或斯皮爾曼相關(guān)系數(shù)鞭光，對于大量的基因數(shù)據(jù)吏廉，該方法非常快惰许。Comp...
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linux BLAST序列比對 （nt/nr庫）
安裝本地blast序列比對軟件席覆，我們可以搜索一個查詢序列定制數(shù)據(jù)庫，例如想研究一個新測序的基因組汹买，或者感興趣的一組蛋白質(zhì)序列佩伤。有時我們希望把程序...
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Seurat 報錯-namespace:spatstat
加載Seurat包報錯，莫名其妙晦毙，之前用的好好的生巡。不知道什么時候安裝包存在兼容性問題，只能先刪除掉见妒。
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STAR序列比對（測試支原體污染序列）轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)唯一比對率特別低孤荣，進一步將未比對到參考基因組的序列提出來比對到NCBI NT庫。發(fā)現(xiàn)多數(shù)序列比對到了Mycoplasma hyor...