在群體遺傳學(xué)研究中惶室，LD連鎖不平衡分析是最常見(jiàn)的分析內(nèi)容啃炸，也是關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)屏轰。如何正確理解并且進(jìn)行相關(guān)的LD連鎖不平衡分析是群體遺傳中很基本的一件事情拯坟。下面和大家一起學(xué)習(xí)一下...
IP屬地：俄勒岡州
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LD衰減圖的理解與應(yīng)用
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用excel操作序列（引物設(shè)計(jì)）介紹 最早是我讀研究生一年級(jí)時(shí)，用VBA處理過(guò)一些DNA序列處理（word）宏蛉、繪制圖片（Powerpoint）肯污，也寫(xiě)過(guò)幾個(gè)excel函數(shù)用于DNA oligo的基本分析和操作...
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高通量測(cè)序數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)記錄（三）：Pathway Analysis及GSEAPathway Analysis討論及基因富集分析軟件（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）使用實(shí)戰(zhàn) 在所有物是人非的景色里彩届，我最中意你伪冰。 背...
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質(zhì)粒系列之再談無(wú)縫連接--Gibson assembly
我們用兩篇文章的篇幅大概講了一遍質(zhì)粒骨架及其各個(gè)要素的介紹：解剖式學(xué)習(xí)一個(gè)質(zhì)粒結(jié)構(gòu)--update[http://www.reibang.com/p/e6c5852f60c...
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轉(zhuǎn)錄組分析5——差異表達(dá)分析差異表達(dá)分析內(nèi)容：? 基因表達(dá)量的標(biāo)準(zhǔn)化方法及可視化? counts，RPKM樟蠕，F(xiàn)PKM贮聂，TPM? PCA圖靠柑、熱圖等? 差異表達(dá)分析及可視化? limma-voom，edge...
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R數(shù)據(jù)可視化17:上判福基圖感覺(jué)100年沒(méi)有上簡(jiǎn)書(shū)歼冰，近2個(gè)月忙于畢業(yè)論文以及公眾號(hào)推文，沒(méi)有時(shí)間更文章耻警。終于前幾天交了論文呢隔嫡，可以回來(lái)更文了。沒(méi)錯(cuò)我只是在為我的懶惰尋找接口甘穿，今天我們來(lái)講一下扇鳎基圖（Sa...
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R 數(shù)據(jù)科學(xué)（十五）—summarize函數(shù)+group_by函數(shù)記住是summarize函數(shù)而不是summarise函數(shù) summarize函數(shù)可以進(jìn)數(shù)據(jù)框折疊成一行 計(jì)數(shù)本質(zhì)上返回的是分組后的行數(shù) group_by為分組函數(shù)，是如果我們...
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標(biāo)準(zhǔn)差與標(biāo)準(zhǔn)誤
標(biāo)準(zhǔn)差 在統(tǒng)計(jì)中温兼，標(biāo)準(zhǔn)差是一種用于量化一組數(shù)據(jù)值的變化或分散程度的度量秸滴。一個(gè)較大的標(biāo)準(zhǔn)差，代表大部分?jǐn)?shù)值和其平均值之間差異較大募判；一個(gè)較小的標(biāo)準(zhǔn)差荡含，代表這些數(shù)值較接近平均值。 ...
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panel.spacing解決了我許久的強(qiáng)迫癥一直以來(lái)畫(huà)分面圖都有一個(gè)小小的缺陷届垫，如圖1所示不能消除分面之間的間距内颗，今天終于發(fā)現(xiàn)原來(lái)可以通過(guò)panel.spacing函數(shù)來(lái)調(diào)整間距，強(qiáng)迫癥終于得到了滿足
