理論基礎(chǔ) 在上篇的比對(duì)中，我們需要糾結(jié)是否真的需要比對(duì)，如果你只需要知道已知基因的表達(dá)情況，那么可以選擇alignment-free工具（例如salmon, sailfish...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：云南
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5双炕、RNAseq(5)--reads count(htseq-count)與基因注釋（bioMart） -
RNAseq比對(duì)流程pipeline腳本自己在參考大牛的基礎(chǔ)上，總結(jié)了RNAseq比對(duì)流程pipeline腳本。在做好前期準(zhǔn)備工作后，可以一步完成從fastq到表達(dá)矩陣的所有步驟叨咖，目前僅支持human Bulk R...
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NCBI下載SRA數(shù)據(jù)的4種方法??作為生命科學(xué)的從事者，不論是老師或者學(xué)生都應(yīng)該用過NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...
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RNAseq分析流程：從測(cè)序Rawdata到Count輸出在之前學(xué)習(xí)snakemake的基礎(chǔ)上啊胶，這里重新又對(duì)之前編寫的pipline進(jìn)行了優(yōu)化甸各，只需要在config.yaml中輸入相應(yīng)的samples，以及參考基因組路徑焰坪，即可以得到...
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PCA原理解讀和繪制方法??該教程的PCA繪圖基于ggplot2趣倾，可以根據(jù)ggplot2語法對(duì)圖片進(jìn)行額外的修改和保存。 1. 基礎(chǔ) PCA：全稱Principal Component Method...
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Linux服務(wù)器硬件情況的查看
對(duì)于服務(wù)器配置的大概情況 一某饰、首先是偏硬件的說明 1儒恋、首先是對(duì)于CPU的說明服務(wù)器CPU性能參數(shù)主要信息可以通過查看/proc/cpuinfo獲得。具體查看指令及效果如下： ...
