pomela

前言 青藏高原是世界上海拔最高姻几、面積最大的高原，平均海拔4500米猖闪。由于低氧鲜棠、低溫和強(qiáng)紫外線等惡劣的環(huán)境條件肌厨，生活在高海拔環(huán)境中的物種面臨著巨大的選擇壓力培慌。 這種嚴(yán)酷的高海拔...

胡小兵plus

一、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 首先柑爸，選取不同物種的Protein數(shù)據(jù)集：Arabidopsis_thaliana.fa吵护；Citrus_grandis.fa；Dimocarpus_longan...

lxmic

作業(yè)要求 需要用安裝好的sratoolkit把sra文件轉(zhuǎn)換為fastq格式的測(cè)序文件表鳍，并且用fastqc軟件測(cè)試測(cè)序文件的質(zhì)量馅而！作業(yè)，理解測(cè)序reads譬圣，GC含量瓮恭，質(zhì)量值，...

山竹山竹px

策略 hmmsearch + blast 單獨(dú)使用或者組合使用 hmmsearch可以做兩次厘熟，第一次使用pfam中的多序列比對(duì)結(jié)果構(gòu)建模型進(jìn)行搜索屯蹦，篩選過結(jié)構(gòu)域后，使用本物種...

水里的硫化鋁

一绳姨、基因家族基礎(chǔ)知識(shí)與研究思路介紹 1.基因家族簡(jiǎn)介 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域（內(nèi)含子外顯子啟動(dòng)子）登澜。轉(zhuǎn)錄本才是基因的研究實(shí)體，轉(zhuǎn)錄本transcript（別名 ...

蟲蟲工工隊(duì)

明晰概念 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域 基因≠CDS 基因應(yīng)該包括：CDS 內(nèi)含子 UTR 啟動(dòng)子 可轉(zhuǎn)錄的區(qū)域是多變的 我們做分析的時(shí)候常用的是蛋白序列谴仙，而蛋白序列...