doubletfinder在去年11月的更新中就已經(jīng)去除了_v3系列的函數(shù)藕坯，以后都不支持seurat的v3，v4的數(shù)據(jù)格式。各位看客為了方便還是使用scdbfinder吧
單細胞數(shù)據(jù)分析筆記3: 雙細胞去除（DoubletFinder, scDblFinder)雙細胞是指由于實驗原因昂芜，在單細胞微流控等流程中某個液滴中含有2個及以上的細胞莹规，而在同一個液滴中的細胞在后續(xù)分析中帶有相同的Cell Barcode，從而會被認為是一個細胞的偽...
Warning message:
In CheckDuplicateCellNames(object.list = objects) :
Some cell names are duplicated across objects provided. Renaming to enforce unique cell names.
這個問題咋解決泌神？你好像沒有處理
2021-05-26 單細胞分析之harmony與Seurat參考：生信會客廳 harmony原理 Harmony需要輸入低維空間的坐標(biāo)值（embedding）良漱，一般使用PCA的降維結(jié)果。Harmony導(dǎo)入PCA的降維數(shù)據(jù)后欢际，會采用so...
原文獻是ssgsea的文獻嗎母市？我找不到4.2的【##讀取已經(jīng)下載好的免疫細胞和對應(yīng)基因列表，來源見文獻附件】
復(fù)現(xiàn)詳解：純R代碼實現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度一 . 從GEO數(shù)據(jù)庫中下載表達矩陣文件 GSE112996_merged_fpkm_table.txtGSE112996_series_matrix.txt损趋，把GSE112...
1患久、GWAS 流程 image.png數(shù)據(jù)質(zhì)控? 1）按分型百分比條件過濾，多數(shù)文章剔除缺失率在20%以上的位點浑槽，樣本量較大的群體中蒋失，可以將缺失率小于50%的位點都保留；? ...
