如圖所示蝙茶,我已經(jīng)下載并且解壓了Mauve,并且我的電腦也已經(jīng)有了java環(huán)境祷安。 解決辦法: 在終端中輸入:export JAVA_CMD=/usr/lib/jvm/java-...
如圖所示蝙茶,我已經(jīng)下載并且解壓了Mauve,并且我的電腦也已經(jīng)有了java環(huán)境祷安。 解決辦法: 在終端中輸入:export JAVA_CMD=/usr/lib/jvm/java-...
@周大俠_1ab4 好的淋肾,非常感謝您镀虐,我試試
Ubuntu安裝有道辭典遇到的問題對于Ubuntu新手來說蹲诀,在該系統(tǒng)上安裝任何軟件都是一項(xiàng)挑戰(zhàn)岸晦。 第一次使用Ubuntu,安裝有道辭典花費(fèi)了不少時(shí)間禁悠,最終還是沒有安裝成功念祭。在這里記下安裝過程中遇到的問題,直到...
@Dong_3cf2 我剛剛?cè)タ戳宋业拿畎欤l(fā)現(xiàn)你之所以發(fā)生這個(gè)錯(cuò)誤是因?yàn)槟闵倭艘粋€(gè)參數(shù)r, 你的錯(cuò)誤提示你少了參數(shù)棒卷,這個(gè)命令是: conda install -c r rstudio --yes
Ubuntu中使用Anaconda安裝R,Rstudio由于我之前使用python的時(shí)候安裝了anaconda,所以我的anaconda就不需要再次安裝顾孽,如果有沒有安裝anaconda,可以參照這個(gè)教程:安裝anaconda-換源...
@Dong_3cf2 把 -c刪除試試
Ubuntu中使用Anaconda安裝R,Rstudio由于我之前使用python的時(shí)候安裝了anaconda,所以我的anaconda就不需要再次安裝比规,如果有沒有安裝anaconda若厚,可以參照這個(gè)教程:安裝anaconda-換源...
@7bae4215e189 網(wǎng)絡(luò)連接有沒有問題?
ubuntu18.04安裝最新版本的R筆記本新添加了硬盤蜒什,所以將ubuntu系統(tǒng)安裝在了新添加的硬盤上测秸。新安裝的系統(tǒng)需要?jiǎng)h除舊的內(nèi)核,使用最新的內(nèi)核灾常。刪除舊內(nèi)核的教程網(wǎng)上有很多霎冯,直接參考照做就行了。使用最新的內(nèi)核...
@止水_7c47 文獻(xiàn)中使用的gProfiler版本比你目前使用的低钞瀑,所以操作上會有不一樣的地方沈撞,建議你去看看官網(wǎng)的操作指南,是需要將得到其中的兩個(gè)文件合并才行雕什。
使用Cytoscape中的Enrichmen進(jìn)行富集分析可視化tMapEnrichment Map是一個(gè)用于功能豐富可視化Cytoscape軟件的插件,必須使用任何可用方法在EnrichmentMap之外生成富集結(jié)果缠俺。將基因集(例如通路和Gen...
@小醫(yī)生007 你猜我猜不猜,哈哈哈
使用Cytoscape中的Enrichmen進(jìn)行富集分析可視化tMapEnrichment Map是一個(gè)用于功能豐富可視化Cytoscape軟件的插件,必須使用任何可用方法在EnrichmentMap之外生成富集結(jié)果贷岸。將基因集(例如通路和Gen...
@凌云月 是的壹士,安裝了很多次都出錯(cuò)
ubuntu18.04安裝最新版本的R筆記本新添加了硬盤,所以將ubuntu系統(tǒng)安裝在了新添加的硬盤上偿警。新安裝的系統(tǒng)需要?jiǎng)h除舊的內(nèi)核躏救,使用最新的內(nèi)核。刪除舊內(nèi)核的教程網(wǎng)上有很多螟蒸,直接參考照做就行了盒使。使用最新的內(nèi)核...
@suyeye 可以重新安裝試一下
使用Cytoscape中的Enrichmen進(jìn)行富集分析可視化tMapEnrichment Map是一個(gè)用于功能豐富可視化Cytoscape軟件的插件,必須使用任何可用方法在EnrichmentMap之外生成富集結(jié)果。將基因集(例如通路和Gen...
@我的一生是傳奇 非常感謝您七嫌,以后還請多多指點(diǎn)
ubuntu18.04安裝最新版本的R筆記本新添加了硬盤忠怖,所以將ubuntu系統(tǒng)安裝在了新添加的硬盤上。新安裝的系統(tǒng)需要?jiǎng)h除舊的內(nèi)核抄瑟,使用最新的內(nèi)核凡泣。刪除舊內(nèi)核的教程網(wǎng)上有很多,直接參考照做就行了皮假。使用最新的內(nèi)核...
@我的一生是傳奇 謝謝您的鼓勵(lì)鞋拟!我會繼續(xù)學(xué)習(xí)下去的
搭建java環(huán)境——安裝GSEA和CytoscapeGSEA和Cytoscape的安裝都需要java環(huán)境,所以首先要搭建好java環(huán)境惹资。在搭建java環(huán)境之前新建一個(gè)虛擬環(huán)境贺纲,將java環(huán)境與外部環(huán)境隔絕起來。我使用的是con...
非常感謝您的鼓勵(lì),謝謝你懈叹!筆芯
ubuntu18.04安裝最新版本的R筆記本新添加了硬盤乖杠,所以將ubuntu系統(tǒng)安裝在了新添加的硬盤上。新安裝的系統(tǒng)需要?jiǎng)h除舊的內(nèi)核澄成,使用最新的內(nèi)核胧洒。刪除舊內(nèi)核的教程網(wǎng)上有很多,直接參考照做就行了墨状。使用最新的內(nèi)核...
Enrichment Map是一個(gè)用于功能豐富可視化Cytoscape軟件的插件,必須使用任何可用方法在EnrichmentMap之外生成富集結(jié)果卫漫。將基因集(例如通路和Gen...
您是不是沒有安裝Rstudio成功呢?
Ubuntu中使用Anaconda安裝R,Rstudio由于我之前使用python的時(shí)候安裝了anaconda,所以我的anaconda就不需要再次安裝肾砂,如果有沒有安裝anaconda列赎,可以參照這個(gè)教程:安裝anaconda-換源...
GSEA是一種無閾值方法,可根據(jù)其差異表達(dá)等級或其他分?jǐn)?shù)對所有基因進(jìn)行分析镐确,無需事先進(jìn)行基因過濾包吝。當(dāng)基因組中的所有或大多數(shù)基因(例如,RNA-seq數(shù)據(jù))可獲得rank時(shí)推薦...
g:Profiler主要有四個(gè)可選工具: g:GOSt用于分析 flat or ranked gene lists以獲得富集特征辫塌; g:Conver用于轉(zhuǎn)換不同類別的基因標(biāo)識...
直接克隆的好處就是快漏策,不會中斷派哲,如果點(diǎn)擊Download Zip的話臼氨,文件太大的話容易失敗。 1. 新建文件夾:mkdir artical_data 2. cd 到1中新建的...
筆記本新添加了硬盤芭届,所以將ubuntu系統(tǒng)安裝在了新添加的硬盤上储矩。新安裝的系統(tǒng)需要?jiǎng)h除舊的內(nèi)核,使用最新的內(nèi)核褂乍。刪除舊內(nèi)核的教程網(wǎng)上有很多持隧,直接參考照做就行了。使用最新的內(nèi)核...
GSEA和Cytoscape的安裝都需要java環(huán)境逃片,所以首先要搭建好java環(huán)境屡拨。在搭建java環(huán)境之前新建一個(gè)虛擬環(huán)境,將java環(huán)境與外部環(huán)境隔絕起來褥实。我使用的是con...