寫在前面：經(jīng)常做轉錄組分析，就是把差異基因搞個火山圖和Venn圖看各組差異基因的共有和特有情況刃鳄⊙嵯危看見有個比較好的選擇，能直觀比較各種處理帶來的影響十性，如下： 來自Nature ...
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轉錄組DEGs聚類熱圖和功能富集分析 -
推薦一本生物信息學相關在線電子書我是在找snakemake參考資料的時候找到的這本在線電子書叛溢，鏈接是 https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/[http...
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【基因課】測序數(shù)據(jù)過濾和質(zhì)控1. 課程大綱 基礎知識 數(shù)據(jù)質(zhì)控 Fastqc結果解讀 數(shù)據(jù)過濾 2. 學習筆記 2.1 基礎知識 2.1.1 測序原理 Sample Prep：DNA隨機打斷加adapt...
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八行代碼搞定內(nèi)參基因篩選-R版本的NormFinder寫在前面 碩士畢業(yè)做的大豆內(nèi)參基因的篩選，當時用了geNorm, NormFinder和BestKeeper三個軟件劲适，geNorm 不需要多說楷掉，Vandesompele教授的...
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Fasta序列文件合并與分割，支持.seq等無頭序列寫在前面 我隱約記得我寫過類似主題霞势，但也并不確定烹植。相關功能，我并不寫使用說明的沖動愕贡，一者是這些功能至少是四五年前就有的草雕，二者是這些功能其實比較簡單，但也并不常用固以。然而墩虹，現(xiàn)在我...
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生物基礎知識-CDS、ORF憨琳、啟動子诫钓、終止子、轉錄因子篙螟、UTR劉小澤寫于2020.2.8大概回顧一下基礎知識 一：ORF與CDS ORF：open reading frame（開放閱讀框） 它是理論上的蛋白編碼區(qū)菌湃，一般是先在DNA序列中...
