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2024-11-07 Notung踩坑記錄
2.9.1.5版本 貌似不需要修改基因樹名字為gene_species格式了 也不需要修改物種名A_b為A-b加勤，直接運行就可以撵摆？挤渔？它浅？for i ...
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2024-07-26 關(guān)于基因組重復(fù)序列的分析
大致上可以分為兩步：第一步是從情況不明（新）基因組中注釋计济。第二步是優(yōu)化和后續(xù)分析 一作岖、注釋重復(fù)序列在不同物種中含量不同惦积，但是有TElib昔馋，比如 ...
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2024-03-01 全基因組circos圖到底怎么畫---使用R包circlize筹吐。
circos可以說是基因組文章必備的主圖了。現(xiàn)在也有好多教程秘遏，先分別探討下個人喜好點丘薛。 circos的軟件“钗＃看官網(wǎng)的圖洋侨，是不是非常酷炫倦蚪。但是真正...
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2024-02-01半年沒寫文章了...寫個總結(jié)理清思路
最近在寫文希坚，其實寫結(jié)論反倒是最簡單的（這里的簡單不是說傳統(tǒng)意義上的簡單，只是不麻煩陵且，動腦子查查其他論文裁僧，實在不行扔給我導(dǎo)就行（并不）），我最討厭...
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2023-07-06依據(jù)WGDI的使用慕购，自己動手寫一個小腳本（注：沒寫完 不好用）
參考來源如何用WGDI進行共線性分析(上) - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/a5054...
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2023-06-02在集群運行腳本時會遇到的一些報錯
在集群運行腳本（python聊疲，perl，sh）時會遇到一些錯誤沪悲∈鄱茫總結(jié)一下，以防手忙腳亂可训。(更新中）很基礎(chǔ)的昌妹，自己打字玩捶枢。 1. 明明已經(jīng)安裝了p...
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2023-05-23 augustus訓(xùn)練正在更新。英文是真的看不習(xí)慣飞崖。參考：使用MAKER進行基因注釋(高級篇之AUGUSTUS模型訓(xùn)練） - 簡書 (jianshu.com)[htt...
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2023-05-23 wgd軟件的安裝烂叔。分析
參考使用wgd進行全基因組復(fù)制分析 - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/12387581...
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2023-05-22比較基因組分析大致流程
1. 下機數(shù)據(jù)的質(zhì)檢，組裝固歪∷饧Γ基因組survey可以預(yù)測基因組大小。 （三代測序長牢裳，但不準(zhǔn)逢防，可以用二代協(xié)助組裝。還可以測HiC進行染色體級別的組裝...