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MEGA構(gòu)建進(jìn)化樹如何用MEGA-X構(gòu)建進(jìn)化樹_生物研究_實(shí)用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]...
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IQ-TREE的使用 - 超快速用極大似然法構(gòu)建進(jìn)化樹
寫在前面 我知道IQ-tree已經(jīng)有很長(zhǎng)一段時(shí)間了狡汉。不過(guò)我一直并沒(méi)有使用它浅悉。主要原因是，常用的快速構(gòu)建ML樹的軟件是FastTree冗酿，如果要求準(zhǔn)確埠对，我會(huì)在服務(wù)器上使用RaxM...
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在線和本地兩種方法構(gòu)建 RAxML 進(jìn)化樹方法和解讀1：在線構(gòu)建RAxML樹 1. CIPRES網(wǎng)站： CIPRES Science Gateway V3.3[http://www.phylo.org/index.php/po...
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Knock in 隨實(shí)驗(yàn)進(jìn)程增添內(nèi)容Knock in 后期要用到KI技術(shù)，現(xiàn)在先敲入一個(gè)熒光練手 目標(biāo) 細(xì)胞：HEK293細(xì)胞 基因：GAPDH基因 改為ActB（原因見(jiàn)下） 選擇標(biāo)記：mNeonGreen（原...
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【R語(yǔ)言】dplyr對(duì)數(shù)據(jù)分組取各組前幾行前面我們介紹過(guò)GO富集分析和結(jié)果可視化 1.GO和KEGG富集分析視頻講解[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin...
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基因組注釋文件（二）| gff 和 gtf文件格式說(shuō)明
簡(jiǎn)介 GFF和GTF是兩種最常用的基因組注釋格式裁替，在信息分析中建庫(kù)時(shí)除了需要fasta文件一般還會(huì)需要這兩種文件项玛，提取需要的信息進(jìn)行注釋。 一弱判、GFF GFF(General...
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本地blast使用技巧之repeat mask
Introduction blast是目前使用最為廣泛襟沮、接受度最高的一個(gè)序列比對(duì)軟件。尤其適用于尋找兩條序列之間最為相似的片段昌腰，以及對(duì)大型核酸或氨基酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索开伏。我們?cè)?..
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MUMMER 兩個(gè)基因組間比較MUMmer出現(xiàn)的歷史背景測(cè)序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長(zhǎng)度遭商，所以一般都是逐個(gè)基因的比較固灵，用的都是BLAST或FASTA通過(guò)逐個(gè)基因聯(lián)配的方式搜索數(shù)據(jù)...
