假設檢驗： 一般步驟： 1.設定假設后需要驗證：假設0一般都是“處理組和對照組無區(qū)別” 2.構建檢驗統(tǒng)計量：根據(jù)樣本數(shù)據(jù)計算統(tǒng)計量和檢驗統(tǒng)計量 3.設定置信區(qū)間：根據(jù)檢驗統(tǒng)計...
IP屬地：遼寧
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【點】p value漂洋、FDR、q value
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p.value和FDR最近用limma作差異分析贴唇，接觸p.value和adj.p.value比較多驴一，今天就重點解釋下p.value和FDR吧： 在topTable函數(shù)的結(jié)果里，我們都會看到p.va...
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R錯誤 Shadow graphics device error: r error 4
我的R在版本由4.2.2更新4.3.1后使用remotes::install_github("YuLab-SMU/HPO.db") BiocManager::install(...
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KEGG注釋：KEGG富集可視化柱狀圖很久很久以前垒手，看到過文章中的KEGG富集可視化結(jié)果圖胡嘿。是對KEGG通路進行注釋的疏魏。后來在一些測序公司的宣傳頁上也見到過類似的圖： 其實這個圖就是多了一個KEGG通路注釋停做，近期...
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【R語言】卡方檢驗和Fisher精確檢驗，復現(xiàn)臨床paper做臨床數(shù)據(jù)分析的時候我們經(jīng)常會用卡方檢驗或者Fisher精確檢驗去看看不同的臨床特征在兩組里面有沒有顯著差異蠢护。今天小編就帶大家來重現(xiàn)一下下面這篇paper的Table2 Ta...
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老大醒腦題-我卻迷糊了
問題鏈接看http://www.bio-info-trainee.com/4458.html 我碰到的問題 1.要不要把每個list變成data.frame,我給變成了，我首...
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GEO數(shù)據(jù)庫 mRNA芯片分析全流程GEO數(shù)據(jù)庫 mRNA芯片分析全流程 我們演示的數(shù)據(jù)集是GSE19136养涮，樣本可分為三組（對照組葵硕，支架組，紫杉醇組）贯吓，具體實驗設計情況請查看鏈接懈凹。本篇文章主要對對照組和支架組...
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GEO芯片數(shù)據(jù)差異表達分析前面簡單給大家介紹過 GEO數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)檢索方法（一）[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4ODE0NTE3OA==&mid=2649210...
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一個GSE有兩個GPL該怎么辦莎莎寫于2020.5.7?今天上午10點鐘準時就醒了，然后和室友磨嘰半天去實驗室打掃衛(wèi)生悄谐，然后簽了字就偷偷溜了??然后回到中校區(qū)買了超級甜的哈密瓜??還有火龍果介评，沃柑，一共是30...
