xiaoxianyu

我從多災(zāi)多難的2020年的11月開始正式學(xué)習(xí)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹童芹，拖拖拉拉地學(xué)到12月。星座運勢告訴我：“你想掌握地大部分技能都可以通過持續(xù)地堅持來獲得×г溃”我心想：信了你的邪。 下...

亮亮就是亮

構(gòu)建物種的系統(tǒng)發(fā)育樹，計算kaks值或者比較基因組學(xué)和進(jìn)化的其他分析都少不了需要尋找同源基因。之前已經(jīng)介紹過Orthomcl的自動化使用谨读，Orthomcl也是目前引用最好的尋...

番茄隨筆

一坛吁、多序列比對能干嘛劳殖？ 下面是多序列比對的主要應(yīng)用： 1. 推測——Extrapolation 可以推測一條未知的aa序列屬于某個已知的蛋白質(zhì)家族或者擁有相似蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域甚至...

Dawn_WangTP

背景 一行命令構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。其實這個想法去年的時就開始構(gòu)思了拨脉。當(dāng)時在給師兄師姐幫忙構(gòu)建幾個基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹哆姻，還是用著以前本科時候就學(xué)會的幾個Windows下的建樹軟件M...

SCI狂人團(tuán)隊

這次分享一下簡單的生信數(shù)據(jù)挖掘發(fā)文思路玫膀，文章發(fā)表在Biomed Research International上矛缨，該期刊的影響因子：2.276，中科院分區(qū)：4區(qū)帖旨，參考范文出處：...

SCI狂人團(tuán)隊

今天分享一篇基因家族的純生信文章，可以說找到一個沒有人做過數(shù)據(jù)挖掘的基因家族解阅，基本上就是坐等發(fā)SCI盟广。今天介紹這篇參考文章發(fā)表在Scientific Reports上，江湖人...

白菜代碼小推車

注：本內(nèi)容需要點的perl編程基礎(chǔ)瓮钥，最好是讀過《perl語言入門》。 本系列是自己平常學(xué)習(xí)工作中的總結(jié)烹吵，每一個實例均為我為了講解而設(shè)置的碉熄，自己試過的，如有錯誤肋拔，望能見諒 Pe...