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群體遺傳學(xué)專題二之GATK實(shí)戰(zhàn)寫在最前面 本次的GATK實(shí)戰(zhàn)用到的raw data是水稻的翎碑,reference是v4版本谬返,具體如下:raw data:EV19-0_HQ_clean_R1.fq/EV19-...
GATK升級(jí)4.0版了,作為一個(gè)call variant的非常常用的軟件日杈,之前我一直是在使用3.8的版本遣铝,這次也正好整理下,將GATK基本分析流程過渡到4.0版本莉擒,看看具體有...
什么是基因組變異 基因組變異是一個(gè)定義比較模糊的概念酿炸。 所謂的變異是相對(duì)于一個(gè)完美的“參考基因組”而言。但是其實(shí)完美的“參考基因組”并不存在涨冀,因?yàn)槲覀冎皇沁x擇某一個(gè)物種里的其...
寫在最前面 本次的GATK實(shí)戰(zhàn)用到的raw data是水稻的填硕,reference是v4版本,具體如下:raw data:EV19-0_HQ_clean_R1.fq/EV19-...
群體遺傳學(xué)習(xí)專題 一之群體遺傳所用技術(shù) 簡(jiǎn)化基因組 技術(shù)說明: 簡(jiǎn)單來說施敢,簡(jiǎn)化基因組就是利用某種方式,獲取基因組上的部分片段狭莱,進(jìn)行標(biāo)記開發(fā)的技術(shù)僵娃。其基本思路都是在酶切之后,對(duì)...
群體遺傳學(xué)習(xí)專題 一之基礎(chǔ)知識(shí)整理 群體遺傳學(xué)研究對(duì)象是生物群體腋妙,這里的群體是指孟德爾氏群體默怨。它是由同一物種組成的較大的有性繁殖群體。群體內(nèi)的個(gè)體間是隨機(jī)交配的骤素,遵循孟德爾遺...