簡(jiǎn)介：相關(guān)圖是基于相關(guān)系數(shù)矩陣?yán)L制的圖答憔。通常是將1個(gè)變量映射到多個(gè)視覺(jué)元素梧躺，所以看起來(lái)很花哨铺根。如果是橢圓： 則橢圓的色相對(duì)應(yīng)相關(guān)性的正負(fù)用踩， 顏色深淺對(duì)應(yīng)相關(guān)性絕對(duì)值大小，越深...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：加州
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corrplot包與ggcorrplot相關(guān)圖
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轉(zhuǎn)錄組入門(mén)(8): 富集分析
我們統(tǒng)一選擇p<0.05而且abs(logFC)大于1的基因?yàn)轱@著差異表達(dá)基因集蔚袍，對(duì)這個(gè)基因集用R包做KEGG/GO超幾何分布檢驗(yàn)分析侧蘸。然后把表達(dá)矩陣和分組信息分別作出cls...
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scale函數(shù)對(duì)矩陣歸一化是按行歸一化，還是按列歸一化偎捎？提出這個(gè)問(wèn)題是在R package：circlize環(huán)狀熱圖[http://www.reibang.com/p/300e00fe61b6]需要對(duì)某個(gè)矩陣進(jìn)行歸一化處理蠢终，雖然...
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r 語(yǔ)言快速出圖——單因素方差帶字母顯著性標(biāo)記相信帶字母的顯著性標(biāo)記圖大家都不會(huì)陌生，在許多文獻(xiàn)中多可以看到類(lèi)似的圖茴她。首先來(lái)看看它長(zhǎng)啥樣 不管是在月末組會(huì)匯報(bào)寻拂，還是自己寫(xiě)文章過(guò)程中都會(huì)用到。今天就一起來(lái)學(xué)一下怎么做丈牢。首先...
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FDR-P值是什么東西祭钉！
概念 FDR，Q value己沛，adjust p valuep-value：衡量一次檢驗(yàn)假陽(yáng)性率的指標(biāo)（False positive rate） 慌核；q value：衡量錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)...
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VCF(variant call format)文件格式詳解vcf格式是做變異(variant)分析的時(shí)候最常見(jiàn)的一種格式，主要包括一些header和位點(diǎn)的信息申尼】遄浚可以參考這個(gè)說(shuō)明文檔學(xué)習(xí)：https://www.internation...
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GWAS分析-說(shuō)人話(huà)（20）-單倍體關(guān)聯(lián)分析前言 來(lái)到這里，已經(jīng)漸漸不是人話(huà)了... 估計(jì)這輩子我也沒(méi)有想到晶姊，我把我最厭惡的東西寫(xiě)出來(lái)扒接， 居然是最多人看的...... 分析方法很多，這一小節(jié)吐槽官網(wǎng)的這一行代碼，大神請(qǐng)...
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GWAS - plink介紹與安裝（Mac）此教程寫(xiě)給像博主一樣的小白钾怔，歡迎各路大神批評(píng)指正 GWAS GWAS全稱(chēng)“全基因組關(guān)聯(lián)分析”碱呼，使用統(tǒng)計(jì)模型找到與性狀關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)，用于分子標(biāo)記選擇（MAS）或者基因定位宗侦。簡(jiǎn)單來(lái)...
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徹底弄懂 Unicode 編碼
查看原文 今天愚臀，在學(xué)習(xí) Node.js 中的 Buffer 對(duì)象時(shí)，注意到它的 alloc 和 from 方法會(huì)默認(rèn)用 UTF-8 編碼矾利，在數(shù)組中每位對(duì)應(yīng) 1 字節(jié)的十六進(jìn)制...
