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  • 如果6年前讀到這本書仑荐，我至少可以省2年

    8月初朋友推薦我看這本《中國人英語自學(xué)方法教程》倔矾，結(jié)果看完后咽白，我腸子都悔青了绞佩。 這本書的封面我有印象，6年前我看到過仗处，但卻沒買约急，因為那時看過一個博主的分享，這本書主要講的是用...

  • 你真厲害炊汤，我覺得你寫出理論來了正驻，特別好

    英語聽力和口語的理論基礎(chǔ)

    為什么我們聽力不好。 很多人把自己聽力不好怪在不會連讀上抢腐，所以認為要學(xué)習(xí)和練習(xí)連讀姑曙，這個想法是不正確的。比如come in迈倍，連讀后聽起來是“comin”伤靠，但之所以能聽懂，并不...

  • 英語聽力和口語的理論基礎(chǔ)

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  • 好文章阀蒂，講的透徹

    5分鐘讓你明白“軟鏈接”和“硬鏈接”的區(qū)別

    今天在知乎上看到一篇十分有趣的問題：如何評價微軟高級工程師癡迷于soft link這一linux常見概念该窗？ 雖然又是知名撕逼王曾某的撕逼帖，但是我還是想就題目中鏈接的問題簡單...

  • 5分鐘讓你明白“軟鏈接”和“硬鏈接”的區(qū)別

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  • Everything還有個Anytxt拖刃，秒搜文件內(nèi)容的，支持各種文檔格式的文字內(nèi)容搜索斩启，一直在用序调，還可以??

  • 2022-06-28

    在進化的尺度下，怎么用時空組和單細胞對進化的理論突破兔簇？ 那么目前的進化有什么經(jīng)典的問題嗎发绢？我要去看科學(xué)雜志提出的100個科學(xué)問題

  • 用PLAM下的mcmctree做分歧時間估計

    用mcmctree做分歧時間估計的時候遇到報錯： 問題是序列不符合phylip格式，每個名字沒有區(qū)分開 1.使用以下命令行將orthofinder處理好的多序列比對結(jié)果垄琐，fa...

  • -x 提取CDS -y 提取pep

    #GTF/GFF格式# gffread入門使用

    首先了解一下GTF/GFF的格式https://asia.ensembl.org/info/website/upload/gff.html兩者的關(guān)系如下 GTF (gene ...

  • 樓主寫的這里：
    ——————————————————
    #根據(jù)hg19.fa提取CDS序列
    gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -y tr_cds.fa
    #翻譯后蛋白序列
    gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -x cds.fa
    ——————————————————————————
    是不是寫反了边酒？我想提CDS文件，用第一個命令狸窘，出來的tr_cds.fa是蛋白文件墩朦，
    用gffread -h（help命令）看了下，是這樣寫的：
    -x write a fasta file with spliced CDS for each GFF transcript（提CDS翻擒？）
    -y write a protein fasta file with the translation of CDS for each record（提的CDS文件轉(zhuǎn)成pep氓涣？）

    所以是不是 “-x” 和“-y” 寫反了？

  • #GTF/GFF格式# gffread入門使用

    首先了解一下GTF/GFF的格式https://asia.ensembl.org/info/website/upload/gff.html兩者的關(guān)系如下 GTF (gene ...

  • 樓主真棒

    R ggplot2 中reorder()如何降序

    喜大普奔陋气，終于解決了reorder()降序排序的問題劳吠；舉例說明一下：首先我有兩列數(shù)據(jù)：第一列是樣品名，第二列是對應(yīng)數(shù)值巩趁。 先畫個簡單的barplot： 如下圖： 我想將x軸排...

  • 生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程

    最近Orthofinder2開始陸續(xù)更新屿讽，文章已經(jīng)投發(fā)到biorkix上，在網(wǎng)上搜了一圈吠裆，關(guān)于Orthofinder的使用的中文教程幾乎是空白的伐谈，這周就借此機會和大家一起來學(xué)...

  • 文筆真流暢，通俗易懂试疙，什么專業(yè)的呀诵棵？

    地球史植物進化《三》

    這是一棵樹，可這顆樹不簡單哪祝旷！生長了多少億年了履澳。 樹中有多少種樹？多少目怀跛？每個目中有多少品種距贷？ 讓我們將會慢慢解讀，這顆樹的樹齡有幾十億年了吻谋。 樹名叫做:植樹進化樹忠蝗。 它是和...

  • 120
    地球史植物進化《三》

    這是一棵樹，可這顆樹不簡單哪漓拾！生長了多少億年了阁最。 樹中有多少種樹？多少目骇两？每個目中有多少品種速种？ 讓我們將會慢慢解讀，這顆樹的樹齡有幾十億年了脯颜。 樹名叫做:植樹進化樹哟旗。 它是和...

  • 寫的真好

    富集分析集錦

    搜羅了幾篇富集分析的文章，把自己覺得特別好的在此集中展出，感謝各位作者闸餐！ 轉(zhuǎn)自劉小澤饱亮，Enrich me! 不管是轉(zhuǎn)錄組，還是芯片數(shù)據(jù)舍沙，或者其他有關(guān)基因的組學(xué)分析近上，每當(dāng)數(shù)據(jù)分...

  • 作者寫的特別詳細加油!

    使用cd-hit對蛋白質(zhì)或核酸序列進行聚類

    2018.9.7 星期四 多云 biolearn cd-hit 是用于蛋白質(zhì)序列或核酸序列聚類的工具，根據(jù)序列的相似度對序列進行聚類以去除冗余的序列拂铡，一般用于構(gòu)建非冗余...

  • 請問你修改了代碼了嗎

    構(gòu)建自己物種的orgDb

    1.首先安裝eggnog-mapper軟件 注釋所需要的物種數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址如下壹无，同時也可以用里面的腳本download_eggnog_data.py下載你所需要的數(shù)據(jù)庫： egg...

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