小明你好，我在做計算EAPC的時候發(fā)現(xiàn)回歸公式里面的year是沒有定義的令花，所以系統(tǒng)會報錯
疾病負擔研究（GBD）-如何優(yōu)雅的展示發(fā)病率數(shù)據(jù)如需要加入GBD數(shù)據(jù)交流群阻桅，請加小編微信“Endoscopy_1991”,小編拉你進群 本文是GBD的第三篇推文，今天我們就以已經(jīng)發(fā)表的高分GBD文章來看下如何展...
IP屬地：廣東
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NextFlow用法1--基本概念基本概念 Nextflow是一個反應(yīng)式工作流框架和編程DSL兼都，可以簡化數(shù)據(jù)密集型pipelines的編寫嫂沉。 它的設(shè)計理念是Linux平臺是數(shù)據(jù)科學的通用語言。Linux提供了...
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bcl2fastq 產(chǎn)生的多個lane 的fastq.gz 合并
bcl2fastq 產(chǎn)生的文件結(jié)果如下（4個lane fastq.gz 文件）： 現(xiàn)在要將多個lane 的fastq.gz合并扮碧，方便下步驟的分析趟章。 方法1： 方法1： 結(jié)果分...
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跟著Nature Genetics學畫圖：R語言ggbio包畫基因結(jié)構(gòu)圖論文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wi...
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用R進行microarray分析（1）Introduction 目前主流的表達譜芯片有兩類：（1）cDNA microarray：將100~5,000bp的cDNA固載到介質(zhì)上 (例如玻璃)，Stanford開發(fā)...
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這個好棒慎王，就是我筆記本沒有Python蚓土，我感覺好像不用這么復(fù)雜
R語言GOplot畫弦圖展示GO富集分析的結(jié)果之如何準備自己的數(shù)據(jù)
我們首先運行幫助文檔里的例子看例子里畫圖用到的數(shù)據(jù)是什么樣子的 查看幫助文檔 運行示例數(shù)據(jù)獲得畫弦圖的數(shù)據(jù) 把這個示例數(shù)據(jù)寫出到csv文件里 作圖的數(shù)據(jù)是這樣的，我們模仿這個...
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R語言GOplot畫弦圖展示GO富集分析的結(jié)果之如何準備自己的數(shù)據(jù)我們首先運行幫助文檔里的例子看例子里畫圖用到的數(shù)據(jù)是什么樣子的 查看幫助文檔 運行示例數(shù)據(jù)獲得畫弦圖的數(shù)據(jù) 把這個示例數(shù)據(jù)寫出到csv文件里 作圖的數(shù)據(jù)是這樣的赖淤，我們模仿這個...
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R語言ggplot2作圖一些好看的顏色搭配這些顏色來自于網(wǎng)頁鏈接 https://www.royfrancis.com/elegant-scientific-graphs-learning-from-examples...
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「摸魚快報004」讓R自己告訴你：我運行完啦你是否經(jīng)常查看大型的R腳本是否運行完而盯著屏幕看了一夜？你是否經(jīng)常程序跑掛了也不知道傻傻的等了一夜第二天一查看才發(fā)現(xiàn)運行到五分鐘的時候就報錯停止了吐限？反正我經(jīng)常有鲜侥！所以今天安利...
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conda create 過程中可能遇到的問題
在conda創(chuàng)建環(huán)境過程中，最常見的問題有幾種1毯盈、鏡像源的問題中科大的鏡像好像有問題剃毒，需要把鏡像源修改為清華源2、網(wǎng)絡(luò)的問題An HTTP error occurred wh...
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聽完直播搂赋、實際操作赘阀、再來看帖子，寫得真的好完整脑奠，我就是那個問題1.基公。。宋欺。??
conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）
有很多的生信軟件都可以通過conda安裝轰豆，省去了很多的安裝胰伍、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件酸休，conda一行命令就搞定了骂租。前兩天有個胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝斑司、修bug的煩惱渗饮。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了宿刮。前兩天有個胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
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我好喜歡他互站，他的code很多都好用，哈哈哈
「摸魚快報007」來自哈佛大學教授的一噸單細胞轉(zhuǎn)錄組學習資料
「摸魚快報007」來自哈佛大學教授的一噸單細胞轉(zhuǎn)錄組學習資料 摸魚快報是一檔我拍腦袋想出來的致力于輕量化地將外網(wǎng)的優(yōu)質(zhì)生物信息學及相關(guān)領(lǐng)域資料帶給大家的小欄目, 力求廢話不多...
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@李毛毛_ac31 認真檢查一下代碼翠胰，這好久的事情了，我記得是指你的data沒有一一對應(yīng)揉抵。我用的就是小潔老師的方法二
p + geom_label_repel(aes(label = CRC),
size = 3,
data = totalgene,
segment.color = '#cccccc',
segment.size = 0.5,
force = T,
color = "#ABB065",
box.padding=unit(0.35, "lines"),
point.padding=unit(0.5, "lines"))在火山圖上標記基因
要玩圖亡容，離不開哈德雷大神的《R數(shù)據(jù)科學》，第1章和21章是專門講圖的冤今，我寫過對應(yīng)的筆記：http://www.reibang.com/p/4a154f6f0de7https...
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剛好今天遇到這問題闺兢，謝謝解答
bam轉(zhuǎn)fastq一直WARNING，并且兩個fastq結(jié)果文件都是空的
下面這個報錯信息較常見戏罢，但是如果每一條bam記錄都是這樣屋谭，就不常見了，我這兩天遇到了這種情況龟糕。先看看正常情況下是如何報錯的： WARNING: Query SRR328680...
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bam轉(zhuǎn)fastq一直WARNING桐磁，并且兩個fastq結(jié)果文件都是空的
下面這個報錯信息較常見，但是如果每一條bam記錄都是這樣讲岁，就不常見了我擂，我這兩天遇到了這種情況。先看看正常情況下是如何報錯的： WARNING: Query SRR328680...
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一個完整的RNA-seq分析pipeline之HISAT2+ StrintTie+ Ballgown以及StringTie和Kallisto的比較(包括得到FPKM校摩、TPM、readscounts)
最重要的參考鏈接 https://pmbio.org/course/#module-06-rnaseq github鏈接：https://github.com/griffit...
